Torbjørn Rognes

Bilde av Torbjørn Rognes
English version of this page
Telefon +47-22844787
Mobiltelefon +47-90755587 90755587
Rom 4422
Brukernavn
Besøksadresse Gaustadalléen 23B Ole Johan Dahls hus 0373 OSLO
Postadresse Postboks 1080 Blindern 0316 OSLO
Andre tilknytninger Institutt for informatikk

Jeg er professor i bioinformatikk og leder Forskningsgruppen for Biomedisinsk Informatikk (BMI) ved Institutt for informatikk, Universitetet i Oslo. Jeg er også forsker ved Avdeling for Mikrobiologi, Rikshospitalet, Oslo Universitetssykehus (OUS), der jeg leder Bioinformatikkgruppen.

Faglige interesser

Jeg forsker på problemstillinger i bioinformatikk, spesielt de som dreier seg om analyse av DNA- og proteinsekvenser. Parallellisering av algoritmer for sekvenssammenligninger, søking og klustring i store datamengder har jeg arbeidet mye med. Særlig har jeg jobbet mye med parallellisering i form av SIMD-teknologi.

Gjennom stillingen ved OUS har jeg også arbeidet en del med anvendt bioinformatikk, ofte knyttet til karakterisering av gener involvert i DNA-reparasjon.

I det siste har jeg arbeidet en del med data fra dypsekvensering, spesielt med metoder for mapping av korte sekvenser mot et referansegenom og variantdeteksjon, samt med klustring og annen prosessering av sekvenser fra metagenomikk-prosjekter.

Forskningsprosjekter

VSEARCH: Open and free 64-bit multithreaded tool for processing metagenomic sequences

SWIPE: Smith-Waterman database searches with inter-sequence SIMD parallelisation

SWARM: A robust and fast clustering method for amplicon-based studies

Publika: Publikasjonsdatabase for Oslo Universitetssykehus

Ledige masteroppgaver

Se listen over alle ledige masteroppgaver ved BMI.

Masterstudenter

  • Torgeir Tynes
  • Marthe Helene Øvergård
  • Kristoffer Mjelva
  • Sean Christian Dutch
  • Mussie Equbatsion Mesfin (sammen med Geir Kjetil Sandve og Lex Nederbragt)
  • Aila Aspås (sammen med Karin Lagesen)
  • Andreas Glasø Skifjeld (sammen med Karin Lagesen)
  • Sebastian Søberg (sammen med Karin Lagesen)
  • Victor Synnes (sammen med Torstein Tengs)

Tidligere masterstudenter

PhD kandidater

  • Ksenia Khelik (sammen med Lex Nederbragt, Geir Kjetil Sandve og Karin Lagesen)
  • Tuva Kristine Thoresen (sammen med Ørnulf Borgan og Bastiaan Star)

Tidligere PhD kandidater

  • Sigve Nakken (sammen med Eivind Hovig)
  • Gard O.S. Thomassen
  • Karin Lagesen (sammen med Dave W. Ussery)

Emner jeg er hovedansvarlig for

  • INF4350 Grunnkurs i bioinformatikk

Emner jeg vanligvis bidrar til

Emner jeg har bidratt til tidligere

Foredrag

23. oktober 2014 - Open access from a researcher’s perspective. Open Access Week, Medical Library, University of Oslo.

Min profil på andre sider

Emneord: Livsvitenskap, Bioinformatikk, Algoritmer, Programmering, Parallellisering, Sekvensanalyse, DNA-reparasjon

Publikasjoner

  • Alsøe, Lene; Sarno, Antonio; Carracedo Huroz, Sergio; Domanska, Diana Ewa; Dingler, Felix; Lirussi, Lisa; Sengupta, Tanima; Tekin, Nuriye Basdag; Jobert, Laure; Alexandrov, Ludmil B.; Galashevskaya, Anastasia; Rada, Cristina; Sandve, Geir Kjetil; Rognes, Torbjørn; Krokan, Hans Einar & Nilsen, Hilde Loge (2017). Uracil Accumulation and Mutagenesis Dominated by Cytosine Deamination in CpG Dinucleotides in Mice Lacking UNG and SMUG. Scientific Reports.  ISSN 2045-2322.  7(1) . doi: 10.1038/s41598-017-07314-5
  • Khelik, Ksenia; Lagesen, Karin; Sandve, Geir Kjetil; Rognes, Torbjørn & Nederbragt, Alexander Johan (2017). NucDiff: in-depth characterization and annotation of differences between two sets of DNA sequences. BMC Bioinformatics.  ISSN 1471-2105.  18(1) . doi: 10.1186/s12859-017-1748-z
  • Kopylova, Evguenia; Navas-Molina, Jose A.; Mercier, Céline; Xu, Zhenjiang Zech; Mahé, Frédéric; He, Yan; Zhou, Hong-Wei; Rognes, Torbjørn; Caporaso, J. Gregory & Knight, Rob (2016). Open-Source Sequence Clustering Methods Improve the State Of the Art. mSystems.  ISSN 2379-5077.  1(1) . doi: 10.1128/mSystems.00003-15 Vis sammendrag
  • Namouchi, Amine; Gomez Munoz, Marta; Frye, Stephan Alfons; Moen, Line Victoria; Rognes, Torbjørn; Tonjum, Tone & Balasingham, Seetha (2016). The Mycobacterium tuberculosis transcriptional landscape under genotoxic stress. BMC Genomics.  ISSN 1471-2164.  17 . doi: 10.1186/s12864-016-3132-1 Vis sammendrag
  • Rognes, Torbjørn; Flouri, Tomáš; Nichols, Ben; Quince, Christopher & Mahé, Frédéric (2016). VSEARCH: A versatile open source tool for metagenomics. PeerJ.  ISSN 2167-8359.  4(10) . doi: 10.7717/peerj.2584 Fulltekst i vitenarkiv. Vis sammendrag
  • Samarakoon, Pubudu Saneth; Sorte, Hanne Sørmo; Stray-Pedersen, Asbjørg; Rødningen, Olaug Kristin; Rognes, Torbjørn & Lyle, Robert (2016). cnvScan: A CNV screening and annotation tool to improve the clinical utility of computational CNV prediction from exome sequencing data. BMC Genomics.  ISSN 1471-2164.  17(51) . doi: 10.1186/s12864-016-2374-2
  • Mahé, Frédéric; Rognes, Torbjørn; Quince, Christopher; de Vargas, Colomban & Dunthorn, Micah (2015). Swarm v2: highly-scalable and high-resolution amplicon clustering. PeerJ Preprints.  ISSN 2167-9843.  3 . doi: 10.7287/peerj.preprints.1222v2
  • Mahé, Frédéric; Rognes, Torbjørn; Quince, Christopher; de Vargas, Colomban & Dunthorn, Micah (2015). Swarm v2: highly-scalable and high-resolution amplicon clustering. PeerJ.  ISSN 2167-8359.  3 . doi: 10.7717/peerj.1420
  • Ougland, Rune; Rognes, Torbjørn; Klungland, Arne & Larsen, Elisabeth (2015). Non-homologous functions of the AlkB homologs. Journal of Molecular Cell Biology.  ISSN 1674-2788.  7(6), s 494- 504 . doi: 10.1093/jmcb/mjv029
  • Yang, Mingyi; Lin, Xiaolin; Rowe, Alexander D.; Rognes, Torbjørn; Eide, Lars & Bjørås, Magnar (2015). Transcriptome analysis of human OXR1 depleted cells reveals its role in regulating the p53 signaling pathway. Scientific Reports.  ISSN 2045-2322.  5 . doi: 10.1038/srep17409
  • Aanes, Håvard; Winata, Cecilia L.; Moen, Lars Fredrik; Østrup, Olga; Mathavan, Sinnakaruppan; Collas, Philippe; Rognes, Torbjørn & Alestrøm, Peter (2014). Normalization of RNA-Sequencing Data from Samples with Varying mRNA Levels. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  9(2) . doi: 10.1371/journal.pone.0089158
  • Mahé, Frédéric; Rognes, Torbjørn; Quince, Christopher; de Vargas, Colomban & Dunthorn, Micah (2014). Swarm: robust and fast clustering method for amplicon-based studies. PeerJ.  ISSN 2167-8359.  2014(1) . doi: 10.7717/peerj.593 Vis sammendrag
  • Mahé, Frédéric; Rognes, Torbjørn; Quince, Christopher; de Vargas, Colomban & Dunthorn, Micah (2014). Swarm: robust and fast clustering method for amplicon-based studies. PeerJ Preprints.  ISSN 2167-9843.  2 . doi: 10.7287/peerj.preprints.386v1
  • Backe, Paul Hoff; Simm, Roger; Lærdahl, Jon Kristen; Dalhus, Bjørn; Fagerlund, Annette; Økstad, Ole Andreas Løchen; Rognes, Torbjørn; Alseth, Ingrun; Kolstø, Anne-Brit & Bjørås, Magnar (2013). A new family of proteins related to the HEAT-like repeat DNA glycosylases with affinity for branched DNA structures. Journal of Structural Biology.  ISSN 1047-8477.  183(1), s 66- 75 . doi: 10.1016/j.jsb.2013.04.007 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Booth, James A.; Thomassen, Gard O Sundby; Rowe, Alexander D.; Weel-Sneve, Ragnhild; Lagesen, Karin; Kristiansen, Knut Ivan; Bjørås, Magnar; Rognes, Torbjørn & Lindvall, Jessica Margareta (2013). Tiling array study of MNNG treated Escherichia coli reveals a widespread transcriptional response. Scientific Reports.  ISSN 2045-2322.  3 . doi: 10.1038/srep03053 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Søberg, Kristoffer; Jahnsen, Tore; Rognes, Torbjørn; Skålhegg, Bjørn Steen & Lærdahl, Jon Kristen (2013). Evolutionary Paths of the cAMP-Dependent Protein Kinase (PKA) Catalytic Subunits. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  8(4) . doi: 10.1371/journal.pone.0060935 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Weel-Sneve, Ragnhild; Kristiansen, Knut Ivan; Odsbu, Ingvild; Dalhus, Bjørn; Booth, James; Rognes, Torbjørn; Skarstad, Kirsten & Bjørås, Magnar (2013). Single Transmembrane Peptide DinQ Modulates Membrane-Dependent Activities. PLoS Genetics.  ISSN 1553-7390.  9(2) . doi: 10.1371/journal.pgen.1003260 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Nordstrand, Line Mari; Furu, Kari; Paulsen, Jonas; Rognes, Torbjørn & Klungland, Arne (2012). Alkbh1 and Tzfp repress a non-repeat piRNA cluster in pachytene spermatocytes. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  40(21), s 10950- 10963 . doi: 10.1093/nar/gks839
  • Ougland, Rune; Lando, David; Jonson, Ida; Dahl, John Arne; Moen, Marivi; Nordstrand, Line Mari; Rognes, Torbjørn; Lee, Jeannie T; Klungland, Arne; Kouzarides, Tony & Larsen, Elisabeth (2012). ALKBH1 Is a Histone H2A Dioxygenase Involved in Neural Differentiation. Stem Cells.  ISSN 1066-5099.  30(12), s 2672- 2682 . doi: 10.1002/stem.1228
  • Søberg, Kristoffer; Larsen, Anja C V; Diskar, Mandy; Backe, Paul Hoff; Bjørås, Magnar; Jahnsen, Tore; Lærdahl, Jon Kristen; Rognes, Torbjørn; Herberg, Friedrich W. & Skålhegg, Bjørn Steen (2012). Identification and Characterization of Novel Mutations in the Human Gene Encoding the Catalytic Subunit Calpha of Protein Kinase A (PKA). PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  7(4) . doi: 10.1371/journal.pone.0034838
  • Lærdahl, Jon Kristen; Korvald, Hanne; Nilsen, Line; Dahl-Michelsen, Kristin; Rognes, Torbjørn; Bjørås, Magnar & Alseth, Ingrun (2011). Schizosaccharomyces pombe encodes a mutated AP endonuclease 1. DNA Repair.  ISSN 1568-7864.  10(3), s 296- 305 . doi: 10.1016/j.dnarep.2010.11.014
  • Rognes, Torbjørn (2011). Faster Smith-Waterman database searches with inter-sequence SIMD parallelisation. BMC Bioinformatics.  ISSN 1471-2105.  12 . doi: 10.1186/1471-2105-12-221
  • Yang, Mingyi; Aamodt, Randi; Dalhus, Bjørn; Balasingham, Seetha; Helle, Ina Høydal; Andersen, Pernille Strøm; Tønjum, Tone; Alseth, Ingrun; Rognes, Torbjørn & Bjørås, Magnar (2011). The ada operon of Mycobacterium tuberculosis encodes two DNA methyltransferases for inducible repair of DNA alkylation damage. DNA Repair.  ISSN 1568-7864.  10(6), s 595- 602 . doi: 10.1016/j.dnarep.2011.03.007
  • Fensgård, Øyvind; Kassahun, Henok; Izabela Agnieszka, Bombik; Rognes, Torbjørn; Lindvall, Jessica Margareta & Nilsen, Hilde (2010). A Two-tiered compensatory response to loss of DNA repair modulates aging and stress response pathways. Aging.  ISSN 1945-4589. Vis sammendrag
  • Møllersen, Linda; Rowe, Alexander D.; Larsen, Elisabeth; Rognes, Torbjørn & Klungland, Arne (2010). Continuous and Periodic Expansion of CAG Repeats in Huntington's Disease R6/1 Mice. PLoS Genetics.  ISSN 1553-7390.  6(12) . doi: 10.1371/journal.pgen.1001242
  • Nordstrand, Line Mari; Svärd, Jessica; Larsen, Elisabeth; Nilsen, Anja; Ougland, Rune; Furu, Kari; Lien, Guro Flor; Rognes, Torbjørn; Namekawa, Satoshi H; Lee, Jeannie T & Klungland, Arne (2010). Mice Lacking Alkbh1 Display Sex-Ratio Distortion and Unilateral Eye Defects. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  5(11) . doi: 10.1371/journal.pone.0013827
  • Thomassen, Gard O Sundby; Sneve, Ragnhild; Rowe, Alexander D.; Booth, James; Lindvall, Jessica M.; Lagesen, Karin; Kristiansen, Knut Ivan; Bjørås, Magnar & Rognes, Torbjørn (2010). Tiling Array Analysis of UV Treated Escherichia coli Predicts Novel Differentially Expressed Small Peptides. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  5(12) . doi: 10.1371/journal.pone.0015356 Vis sammendrag
  • Ambur, Ole Herman; Davidsen, Tonje; Frye, Stephan Alfons; Balasingham, Seetha; Lagesen, Karin; Rognes, Torbjørn & Tønjum, Tone (2009). Genome dynamics in major bacterial pathogens. FEMS Microbiology Reviews.  ISSN 0168-6445.  33(3), s 453- 470 . doi: 10.1111/j.1574-6976.2009.00173.x
  • Nakken, Sigve; Rognes, Torbjørn & Hovig, Eivind (2009). The disruptive positions in human G-quadruplex motifs are less polymorphic and more conserved than their neutral counterparts. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  37(17), s 5749- 5756 . doi: 10.1093/nar/gkp590
  • Nakken, Sigve; Rødland, Einar Andreas; Rognes, Torbjørn & Hovig, Eivind (2009). Large-scale inference of the point mutational spectrum in human segmental duplications. BMC Genomics.  ISSN 1471-2164.  10 . doi: 10.1186/1471-2164-10-43
  • Robertson, AB; Klungland, A; Rognes, T & Leiros, Ingar (2009). DNA Repair in Mammalian Cells. Cellular and Molecular Life Sciences (CMLS).  ISSN 1420-682X.  66(6), s 981- 993 . doi: 10.1007/s00018-009-8736-z
  • Skotheim, Rolf Inge; Thomassen, Gard O Sundby; Eken, Marthe; Lind, Guro Elisabeth; Micci, Francesca; Ribeiro, FR; Cerveira, N; Teixeira, MR; Heim, Sverre; Rognes, Torbjørn & Lothe, Ragnhild A (2009). A universal assay for detection of oncogenic fusion transcripts by oligo microarray analysis. Molecular Cancer.  ISSN 1476-4598.  8 . doi: 10.1186/1476-4598-8-5
  • Thomassen, Gard O Sundby; Rowe, Alexander D.; Lagesen, Karin; Lindvall, Jessica Margareta & Rognes, Torbjørn (2009). Custom Design and Analysis of High-Density Oligonucleotide Bacterial Tiling Microarrays. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  4(6)
  • Cameron, J; Holla, OL; Laerdahl, JK; Kulseth, MA; Ranheim, T; Rognes, Torbjørn; Berge, KE & Leren, TP (2008). Characterization of novel mutations in the catalytic domain of the PCSK9 gene. Journal of Internal Medicine.  ISSN 0954-6820.  263(4), s 420- 431 . doi: 10.1111/j.1365-2796.2007.01915.x
  • Cameron, Jamie; Holla, Øystein Lunde; Lærdahl, Jon Kristen; Kulseth, Mari Ann; Ranheim, Trine; Rognes, Torbjørn; Berge, Knut Erik & Leren, Trond Paul (2008). Characterization of novel mutations in the catalytic domain of the PCSK9 gene. Journal of Internal Medicine.  ISSN 0954-6820.  263(4), s 420- 431 . doi: 10.1111/j.1365-2796.2007.01915.x
  • Dalhus, Bjørn; Helle, Ina Høydal; Backe, Paul Hoff; Alseth, Ingrun; Rognes, Torbjørn; Bjørås, Magnar & Lærdahl, Jon Kristen (2007). Structural insight into repair of alkylated DNA by a new superfamily of DNA glycosylases comprising HEAT-like repeats. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  35(7), s 2451- 2459 . doi: 10.1093/nar/gkm039
  • Klungland, Arne; Lærdahl, Jon Kristen & Rognes, Torbjørn (2007). OGG1: From Structural Analysis to the Knockout Mouse, In Mark D. Evans & Marcus S. Cooke (ed.),  Oxidative Damage to Nucleic Acids.  Springer Science+Business Media B.V..  ISBN 9780387729732.  Chapter 5.  s 67 - 80
  • Lagesen, K; Hallin, P; Rødland, Einar Andreas; Staerfeldt, HH; Rognes, T & Ussery, DW (2007). RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  35 . doi: 10.1093/nar/gkm160 Vis sammendrag
  • Nakken, Sigve; Alseth, Ingrun & Rognes, Torbjørn (2007). Computational prediction of the effects of non-synonymous single nucleotide polymorphisms in human DNA repair genes. Neuroscience.  ISSN 0306-4522.  145 . doi: 10.1016/j.neuroscience.2006.09.004
  • Alseth, Ingrun; Rognes, Torbjørn; Lindbäck, Toril; Solberg, Inger; Robertsen, Kristin; Kristiansen, Knut Ivan; Mainieri, Davide; Lillehagen, Lucy; Kolstø, Anne-Brit & Bjørås, Magnar (2006). A new protein superfamily includes two novel 3-methyladenine DNA glycosylases from Bacillus cereus, AlkC and AlkD. Molecular Microbiology.  ISSN 0950-382X.  59 . doi: 10.1111/j.1365-2958.2006.05044.x
  • Alseth, Ingrun; Rognes, Torbjørn; Lindbäck, Toril; Solberg, Inger; Robertsen, Kristin; Kristiansen, Knut Ivan; Mainieri, Davide; Lillehagen, Lucy; Kolstø, Anne-Brit & Bjørås, M. (2006). A new protein superfamily includes two novel 3-methyladenine DNA glycosylases from Bacillus cereus, AlkC and AlkD. Molecular Microbiology.  ISSN 0950-382X.  59(5), s 1602- 1609 Vis sammendrag
  • Thomassen, Gard O. S.; Rosok, Oystein & Rognes, Torbjørn (2006). Computational prediction of microRNAs encoded in viral and other genomes. Journal of Biomedicine and Biotechnology.  ISSN 1110-7243.
  • Sætrom, Pål; Sneve, Ragnhild; Kristiansen, Knut Ivan; Snøve, Ola; Grünfeld, Thomas; Rognes, Torbjørn & Seeberg, Erling Christen (2005). Predicting non-coding RNA genes in Escherichia coli with boosted genetic programming. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  33, s 3263- 3270
  • Sæbø, Per Eystein; Andersen, SM; Myrseth, Jon; Lærdahl, Jon Kristen & Rognes, Torbjørn (2005). PARALIGN: rapid and sensitive sequence similarity searches powered by parallel computing technology. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  33 . doi: 10.1093/nar/gki423
  • Davidsen, Tonje; Rødland, Einar Andreas; Lagesen, Karin; Seeberg, Erling Christen; Rognes, Torbjørn & Tønjum, Tone (2004). Biased distribution of DNA uptake sequences towards genome maintenance genes. Nucleic Acids Research.  ISSN 0305-1048.  32(3), s 1050- 1058

Se alle arbeider i Cristin

  • Dalhus, Bjørn; Backe, Paul Hoff; Lærdahl, Jon Kristen; Rowe, Alexander D.; Blicher, Pernille; Forstrøm, Rune Johansen; Rognes, Torbjørn & Bjørås, Magnar (2015). Helse Sør-Øst Core Facility for Structural Biology and Bioinformatics.
  • Hovig, Eivind & Rognes, Torbjørn (2015). Bioinformatikk - å forstå teksten, I: Dag Olav Hessen; Thore Lie & Nils Christian Stenseth (red.),  Mendels arv - Genetikkens æra.  Gyldendal Norsk Forlag A/S.  ISBN 978-82-05-45818-5.  Kapittel 13.  s 329 - 354
  • Andersen, Pernille Strøm; Backe, Paul Hoff; Lærdahl, Jon Kristen; Rowe, Alexander; Forstrøm, Rune Johansen; Rognes, Torbjørn; Bjørås, Magnar & Dalhus, Bjørn (2014). Helse Sør-Øst Core Facility for Structural Biology and Bioinformatics.
  • Rognes, Torbjørn (2014). Open access from a researcher’s perspective.
  • Nederbragt, Alexander Johan; Tørresen, Ole Kristian; Khelik, Ksenia; Lagesen, Karin; Rounge, Trine Ballestad; Star, Bastiaan; Tina, Kirubakaran G.; Berg, Paul Ragnar; Rognes, Torbjørn; Jentoft, Sissel; Winer, Roger; Dewar, Ken & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2012). Challenges and Opportunities for Improving the Atlantic Cod Genome Assembly and Annotation.
  • Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan; Lagesen, Karin; Khelik, Ksenia; Rognes, Torbjørn; Jentoft, Sissel & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2012). Improving the cod genome with the use of multi-platform sequencing data.
  • Ambur, Ole Herman; Alfsnes, Kristian; Hovland, Eirik; Homberset, Håvard; Lærdahl, Jon Kristen; Frye, Stephan Alfons; Rognes, Torbjørn; Støen, Mari & Tønjum, Tone (2010). Mechanisms of neisserial transformation and the evolution of sexual reproduction.
  • Nakken, Sigve & Rognes, Torbjørn (2010). Inference of molecular mechanisms from sequence patterns in human DNA variation.
  • Thomassen, Gard O Sundby & Rognes, Torbjørn (2010). Design, analysis and applications of custom high-density oligonucleotide microarrays. Series of dissertations submitted to the Faculty of Medicine, University of Oslo. 965.
  • Fensgård, Øyvind; Lindvall, Jessica Margareta; Kassahun, Henok; Rognes, Torbjørn & Nilsen, Hilde (2009). Microarray analysis of BER mutants.
  • Fensgård, Øyvind; Lindvall, Jessica; Kassahun, Henok; Rognes, Torbjørn & Nilsen, Hilde (2009). Microarray analysis of BER mutants.
  • Lagesen, Karin & Rognes, Torbjørn (2008). Computational characterization of ribosomal RNAs in prokaryotes. Dissertation for the degree of Dr.Med.. 709.
  • Robertsen, Kristin; Kristoffersen, Anja Bråthen & Rognes, Torbjørn (2006). Phylogenetic profiles for identifying new DNA-repair proteins.
  • Rognes, Torbjørn (2006). PARALIGN: Rapid Sequence Similarity Searches Utilizing Several Levels of Parallelism.
  • Davidsen, Tonje; Rødland, Einar Andreas; Lagesen, Karin; Frye, Stephan Alfons; Ambur, Ole Herman; Rognes, Torbjørn & Tonjum, Tone (2003). Biased distribution of bacterial DNA uptake sequences towards genome maintenance genes.
  • Davidsen, Tonje; Frye, Stephan Alfons; Balasingham, Seetha; Assalkhou, Reza; Rognes, Torbjørn; Bjørås, Magnar; Seeberg, Erling Christen & Tonjum, Tone (2002). Genome maintenance in Neisseria meningitidis: the role of base excision repair.

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 4. nov. 2010 14:15 - Sist endret 18. nov. 2016 14:38