Tom Kristensen

Bilde av Tom Kristensen
English version of this page
Telefon +47-22856629
Rom Rom 2130
Brukernavn
Besøksadresse Blindernveien 31 None 0316 OSLO

Faglige interesser

Jeg er interessert i teknologier for DNA-sekvensering og metoder for å trekke ut biologisk informasjon fra sekvensene. Som medlem av Bakteriocingruppen er jeg spesielt interessert i antibakterielle peptider, deres virkningsmekanisme og hvordan bakteriene som danner dem unngår å drepes av sine egne produkter.

Undervisning

MBV3040 - Nukleinsyrenes biokjemi
MBV3070 -Bioinformatikk
 

Bakgrunn

Jeg tok hovedfag i biokjemi ved Biokjemisk institutt, UiO i 1971. Etter 6 år som vit. ass. ved Biokjemisk institutt og stipendiatstilling i gruppen til Hans Prydz ved Institutt for indremedisinsk forskning, Rikshospitalet, tok jeg dr. philos. graden ved UiO i 1984. Sammen med øvrige medlemmer av Prydz-gruppen flyttet jeg til Bioteknologisenteret i Oslo da det ble åpnet. Jeg hadde flere forskningopphold ved EMBL i gruppen til Wilhelm Ansorge, hvor vi arbeidet med utvikling av et system for automatisert DNA-sekvensering. Ved BIoteknologisenteret ledet jeg et servicesenter for DNA-sekvensering basert på denne teknologien. I 1994 ble jeg ansatt som førsteamanuensis ved Biokjemisk institutt. Stillingen ble senere omgjort til et professorat og Biokjemisk institutt ble med tiden slått sammen med de molekylærbiologiske miljøene og Avdeling for fysiologi fra Biologisk institutt, for dannelse av Institutt for molekylær biovitenskap.

Verv

Nettredaktør ved IMBV

2011: Generalsekretær elekt i Norsk biokjemisk selskap (NBS)

Samarbeid

Jeg er medlem av utviklingsmiljøet MERG (Microbial Evolution Research Group) og samarbeider med flere labgruppeledere der. 

Emneord: Biokjemi, Molekylærbiologi, Mikrobiologi, Genteknologi

Publikasjoner

  • Taiaroa, George; Samuelsen, Ørjan; Kristensen, Tom; Økstad, Ole Andreas & Heikal, Adam (2018). Complete Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa K34-7, a Carbapenem-Resistant Isolate of the High-Risk Sequence Type 233. Microbiology Resource Announcements.  ISSN 2169-8287.  7(4), s 1- 2 . doi: 10.1128/MRA.00886-18 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Ekblad, Bie; Nissen-Meyer, Jon & Kristensen, Tom (2017). Whole-genome sequencing of mutants with increased resistance against the two-peptide bacteriocin plantaricin JK reveals a putative receptor and potential docking site. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203. . doi: 10.1371/journal.pone.0185279 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Krabberød, Anders Kristian; Orr, Russell; Bråte, Jon; Kristensen, Tom; Bjørklund, Kjell Rasmus & Shalchian-Tabrizi, Kamran (2017). Single cell transcriptomics, mega-phylogeny and the genetic basis of morphological innovations in Rhizaria. Molecular biology and evolution.  ISSN 0737-4038. . doi: /10.1093/molbev/msx075 Vis sammendrag
  • Oppegård, Camilla; Kjos, Morten; Veening, Jan-Willem; Nissen-Meyer, Jon & Kristensen, Tom (2016). A putative amino acid transporter determines sensitivity to the two-peptide bacteriocin plantaricin JK. MicrobiologyOpen.  ISSN 2045-8827. . doi: 10.1002/mbo3.363 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Kjos, Morten; Oppegård, Camilla; Diep, Dzung Bao; Nes, Ingolf; Veening, Jan-Willem; Nissen-Meyer, Jon & Kristensen, Tom (2014). Sensitivity to the two-peptide bacteriocin lactococcin G is dependent on UppP, an enzyme involved in cell-wall synthesis. Molecular Microbiology.  ISSN 0950-382X.  92(6), s 1177- 1187 . doi: 10.1111/mmi.12632
  • Håvelsrud, Othilde Else; Haverkamp, Thomas Hendricus Augustus; Kristensen, Tom; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Rike, Anne Gunn Larsen (2013). Metagenomics in CO2 Monitoring. Energy Procedia.  ISSN 1876-6102.  37, s 4215- 4233 . doi: 10.1016/j.egypro.2013.06.324 Fulltekst i vitenarkiv. Vis sammendrag
  • Sogge, Hanne; Rohrlack, Thomas; Rounge, Trine Ballestad; Sønstebø, Jørn Henrik; Tooming-Klunderud, Ave; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2013). Gene flow, recombination, and selection in cyanobacteria: population structure of geographically related Planktothrix Freshwater Strains. Applied and Environmental Microbiology.  ISSN 0099-2240.  79(2), s 508- 515 . doi: 10.1128/AEM.02417-12 Fulltekst i vitenarkiv. Vis sammendrag
  • Uzelac, Gordana; Kojic, Milan; Lozo, Jelena; Aleksandrzak-Piekarczyk, Tamara; Gabrielsen, Christina; Kristensen, Tom; Nes, Ingolf; Diep, Dzung Bao & Topisirovic, Ljubisa (2013). A Zn-dependent metallopeptidase is responsible for sensitivity to LsbB, a class II leaderless bacteriocin of Lactococcus lactis subsp. lactis BGMN1-5. Journal of Bacteriology.  ISSN 0021-9193. . doi: 10.1128/JB.00859-13
  • Bråte, Jon; Krabberød, Anders Kristian; Dolven, Jane Karine Lønne; Ose, Randi Frida; Kristensen, Tom; Bjørklund, Kjell Rasmus & Shalchian-Tabrizi, Kamran (2012). Radiolaria Associated with Large Diversity of Marine Alveolates. Protist.  ISSN 1434-4610.  163(5), s 767- 777 . doi: 10.1016/j.protis.2012.04.004 Vis sammendrag
  • Håvelsrud, Othilde Else; Haverkamp, Thomas Hendricus Augustus; Kristensen, Tom; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Rike, Anne Gunn Larsen (2012). Metagenomic and geochemical characterization of pockmarked sediments overlaying the Troll petroleum reservoir in the North Sea. BMC Microbiology.  ISSN 1471-2180.  12(203) . doi: 10.1186/1471-2180-12-203 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Håvelsrud, Othilde Else; Haverkamp, Thomas Hendricus Augustus; Kristensen, Tom; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Rike, Anne Gunn Larsen (2011). A metagenomic study of methanotrophic microorganisms in Coal Oil Point seep sediments. BMC Microbiology.  ISSN 1471-2180.  11 . doi: 10.1186/1471-2180-11-221 Fulltekst i vitenarkiv.
  • Krabberød, Anders Kristian; Bråte, Jon; Dolven, Jane Karine Lønne; Ose, Randi Frida; Klaveness, Dag; Kristensen, Tom; Bjørklund, Kjell Rasmus & Shalchian-Tabrizi, Kamran (2011). Radiolaria Divided into Polycystina and Spasmaria in Combined 18S and 28S rDNA Phylogeny. PLoS ONE.  ISSN 1932-6203.  6(8) . doi: 10.1371/journal.pone.0023526 Vis sammendrag
  • Rounge, Trine Ballestad; Rohrlack, Thomas; Decenciere, Fernandiere Beatriz; Edvardsen, Bente; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2010). SUBPOPULATION DIFFERENTIATION ASSOCIATED WITH NONRIBOSOMAL PEPTIDE SYNTHETASE GENE CLUSTER DYNAMICS IN THE CYANOBACTERIUM PLANKTOTHRIX SPP.1. Journal of Phycology.  ISSN 0022-3646.  46(4), s 645- 652 . doi: 10.1111/j.1529-8817.2010.00856.x
  • Ellefsen, Stian; Stensløkken, Kåre-Olav; Fagernes, Cathrine Elisabeth; Kristensen, Tom & Nilsson, Gøran Erik (2009). Expression of genes involved in GABAergic neurotransmission in anoxic crucian carp brain (Carassius carassius). Physiological Genomics.  ISSN 1094-8341.  36(2), s 61- 68 . doi: 10.1152/physiolgenomics.90301.2008
  • Rounge, Trine Ballestad; Rohrlack, Thomas; Nederbragt, Alexander Johan; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2009). A genome-wide analysis of nonribosomal peptide synthetase gene clusters and their peptides in a Planktothrix rubescens strain. BMC Genomics.  ISSN 1471-2164.  10 . doi: 10.1186/1471-2164-10-396
  • Fewer, DP; Tooming-Klunderud, Ave; Jokela, J; Wahsten, M; Rouhiainen, L; Kristensen, Tom; Rohrlack, T; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Sivonen, K (2008). Natural occurrence of microcystin synthetase deletion mutants capable of producing microcystins in strains of the genus Anabaena (Cyanobacteria). Microbiology.  ISSN 1350-0872.  154, s 1007- 1014 . doi: 10.1099/mic.0.2007/016097-0
  • Ellefsen, Stian; Sandvik, Guro Katrine; Larsen, Helene Kile; Stensløkken, Kåre-Olav; Hov, Dag Are Steenhoff; Kristensen, Tom & Nilsson, Gøran Erik (2008). Expression of genes involved in excitatory neurotransmission in anoxic crucian carp (Carassius carassius) brain. Physiological Genomics.  ISSN 1094-8341.  35, s 5- 17
  • Ellefsen, Stian; Stenslokken, KO; Sandvik, Guro Katrine; Kristensen, Tom & Nilsson, Gøran Erik (2008). Improved normalization of real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction data using an external RNA control. Analytical Biochemistry.  ISSN 0003-2697.  376 . doi: 10.1016/j.ab.2008.01.028
  • Rounge, Trine Ballestad; Rohrlack, Thomas; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2008). Recombination and selectional forces in cyanopeptolin NRPS operons from highly similar, but geographically remote Planktothrix strains. BMC Microbiology.  ISSN 1471-2180.  8 . doi: 10.1186/1471-2180-8-141
  • Tooming-Klunderud, Ave; Fewer, DP; Rohrlack, Thomas; Jokela, J; Rouhiainen, L; Sivonen, K; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2008). Evidence for positive selection acting on microcystin synthetase adenylation domains in three cyanobacterial genera. BMC Evolutionary Biology.  ISSN 1471-2148.  8 . doi: 10.1186/1471-2148-8-256
  • Tooming-Klunderud, Ave; Mikalsen, Bjørg; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2008). The mosaic structure of the mcyABC operon in Microcystis. Microbiology.  ISSN 1350-0872.  154, s 1886- 1899 . doi: 10.1099/mic.0.2007/015875-0
  • Rounge, Trine Ballestad; Rohrlack, Thomas; Tooming-Klunderud, Ave; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2007). Comparison of cyanopeptolin genes in Planktothrix, Microcystis, and Anabaena strains: Evidence for independent evolution within each genus. Applied and Environmental Microbiology.  ISSN 0099-2240.  73, s 7322- 7330 . doi: 10.1128/AEM.01475-07
  • Tooming-Klunderud, Ave; Rohrlack, Thomas; Shalchian-Tabrizi, Kamran; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2007). Structural analysis of a non-ribosomal halogenated cyclic peptide and its putative operon from Microcystis: implications for evolution of cyanopeptolins. Microbiology.  ISSN 1350-0872.  153(5), s 1382- 1393 . doi: 10.1099/mic.0.2006/001123-0
  • Kristensen, V. N.; Kristensen, Vessela Nedelcheva; Kristensen, T.; Børresen-Dale, Anne-Lise & Kristensen, Tom Arne (2001). Hypervariable area in the 5´flanking region of GSTP1, previously reported as a minisatellite ATAAA repeat. Human Mutation.  ISSN 1059-7794.  17, s 238- 239 Vis sammendrag
  • Huynh, Ngoc Trang Thi; Vad, Randi; Kristensen, Tom & Øyen, Tordis Beate (2001). The Genes of Two G-Proteins Involved in Protein Transport in Pichia pastoris. Biochemical and Biophysical Research Communications - BBRC.  ISSN 0006-291X.  280(2), s 454- 459 . doi: 10.1006
  • Huynh, Trang Thi Ngoc; Vad, Randi; Kristensen, Tom Arne & Øyen, Tordis Beate (2001). The genes of two G-proteins involved in protein transport in Pichia pastoris. Biochemical and Biophysical Research Communications - BBRC.  ISSN 0006-291X.  180(2), s 454- 459 Vis sammendrag
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (2001). Genetic polymorphism and variation in steroid hormone metabolism.: connection with risk of developing breast neoplasms, In  Vopr. Onkol.   s 156 - 159
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Kelefiotis, Dimitris; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (2001). High-throughput methods for detection of genetic variation. BioTechniques.  ISSN 0736-6205.  30, s 318- 332 Vis sammendrag
  • Tveit, Heidi & Kristensen, Tom Arne (2001). A fluorescence-based DNA polymerase assay. Analytical Biochemistry.  ISSN 0003-2697.  189, s 96- 98 Vis sammendrag
  • Warsame, Abdirashid; Vad, Randi; Kristensen, Tom Arne & Øyen, Tordis Beate (2001). Characterisation of a gene encoding a Pichia pastoris protein disulphide isomerase (PpPDI). Biochemical and Biophysical Research Communications - BBRC.  ISSN 0006-291X.  281, s 1176- 1182 Vis sammendrag
  • Kristensen, Tom Arne; Kristensen, Vessela Nedelcheva & Børresen-Dale, Anne-Lise (2000). High-throughput screening for known mutations by automated analysis of single sequencing reactions, In John D. Burczak & Elaine Mardis (ed.),  Polymorphism Detection & Analysis.  Eaton Publishing, Natick MA, USA.  ISBN 1-881299-47-3.  s 61 - 67 Vis sammendrag
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Yoshimura, Noriko; Haraldsen, E.; Lønning, Per Eystein; Erikstein, Bjørn; Kåresen, Rolf; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (2000). Genetic variants of CYP19 (arometase) and breast cancer risk. Oncogene.  ISSN 0950-9232.  19(10), s 1329- 1333
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Yoshimura, Noriko; Haraldsen, Ellen Christine; Lønning, Per Eystein; Erikstein, Bjørn; Kåresen, Rolf; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (2000). Genetic variants of CYP19 (aromatase) and breast cancer risk. Oncogene.  ISSN 0950-9232.  19(10), s 1329- 1333 Vis sammendrag
  • Kristensen, Tom Arne; Kristensen, Vessela Nedelcheva & Børresen-Dale, Anne-Lise (1998). High-thorughput screening for known mutations by automated analysis of single sequencing reaction. BioTechniques.  ISSN 0736-6205.  24, s 832- 835
  • Kristensen, Tom Arne; Kristensen, Vessela Nedelcheva & Børresen-Dale, Anne-Lise (1998). High-throughput screening for known mutations by automated analysis of single sequencing reactions. BioTechniques.  ISSN 0736-6205.  24, s 832- 835
  • Nasir, Achmad I.; Gundersen, Lise-Lotte; Rise, Frode; Antonsen, Øyvind; Kristensen, Tom Arne; Langhelle, B.; Bast, Aalt; Custers, Ilse; Haenen, Guido R. M. M. & Wikstrøm, Håkan (1998). Inhibition of Lipid Peroxidation mediated by Indolizines. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters.  ISSN 0960-894X.  s 1828- 1832 Vis sammendrag

Se alle arbeider i Cristin

  • Heikal, Adam; Samuelsen, Ørjan; Kristensen, Tom & Økstad, Ole Andreas Løchen (2017). Complete genome sequence of a multidrug-resistant, blaNDM-1-expressing Klebsiella pneumoniae K66-45 clinical isolate from Norway. Genome Announcements.  ISSN 2169-8287.  5:e00601(27), s 1- 2 . doi: 10.1128/genomeA.00601-17
  • Kristensen, Tom; Nissen-Meyer, Jon; Oppegård, Camilla; Ekblad, Bie; Kjos, Morten; Diep, Dzung Bao & Nes, Ingolf (2015). Whole genome sequencing as a tool to elucidate the mechanism of action of AMPs.
  • Kristensen, Tom; Kjos, Morten; Oppegård, Camilla; Diep, Dzung Bao; Nes, Ingolf & Nissen-Meyer, Jon (2014). Identification of bacteriocin resistance-inducing mutations by whole genome sequencing without a reference genome: The putative receptor of plantaricin JK.
  • Oppegård, Camilla; Kjos, Morten; Diep, Dzung Bao; Nes, Ingolf; Veening, Jan-Willem; Nissen-Meyer, Jon & Kristensen, Tom (2014). Genome sequencing of lactococcin G-resistant strains identified UppP, an enzyme involved in cell wall synthesis, as a putative bacteriocin receptor.
  • Kristensen, Tom; Nissen-Meyer, Jon; Diep, Dzung Bao; Oppegård, Camilla; Nes, Ingolf & Kjos, Morten (2013). Genomic sequencing as a tool to identify bacteriocin receptors.
  • Kristensen, Tom (2013). Bioteknologi - til glede og fortvilelse.
  • Rike, Anne Gunn Larsen; Håvelsrud, Othilde Else; Haverkamp, Thomas Hendricus Augustus; Kristensen, Tom & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2013). Metagenomics in methane seep detection and studies of the microbial methane sediment filter.
  • Nissen-Meyer, Jon; Kristensen, Tom; Diep, Dzung Bao & Nes, Ingolf (2012). Bakteriosiner: En gruppe antimikrobielle peptider med et stort potensial til å bekjempe patogene bakterier. NBS-nytt.  ISSN 0801-3535.  3
  • Bråte, Jon; Krabberød, Anders Kristian; Dolven, Jane Karine Lønne; Ose, Randi Frida; Kristensen, Tom; Bjørklund, Kjell Rasmus & Shalchian-Tabrizi, Kamran (2010). Diversity of unculturable Radiolaria and their symbionts revealed by 18S rDNA phylogeny.
  • Kristensen, Tom (2009). «Scavenger» – fjerner det som er uønsket. Tidsskrift for Den norske legeforening.  ISSN 0029-2001.  129(10), s 1016- 1016 . doi: 10.4045/tidsskr.09.0362
  • Kristensen, Tom (2006). Mikroterrorister - bakterie-, virus- og soppinfeksjoner som truer vår helse.
  • Kristensen, Tom (2005). Nobelprisen i kjemi, I: Øyvind Reisegg (red.),  Aschehoug og Gyldendals Store Norske Årbok.  Kunnskapsforlaget.  ISBN 82-573-1603-2.  Nobelprisen i kjemi.  s 444 - 446
  • Antonsen, Øyvind Gunnar; Kristensen, Tom Arne; Langhelle, B.; Fosnes, K.; Larsen, V.; Gundersen, Lise-Lotte; Rise, Frode; Bast, Aalt; Custers, Ilse & Haenen, Guido R. M. M. (2001). Synthesis of Indolizines and Pyrrolo[1,2-b]pyridazine with Antioxidant Properties.
  • Kristensen, Tom Arne; Kalleberg, Ingvild Berlin & Plagemann, Thomas Peter (2001). Implementing Configurable Signalling in the MULTE-ORB.
  • Kristensen, Tom Arne (2000, 04. januar). Kappløpet om genene. [Radio].  Oslo : NRK P2 radio. Vis sammendrag
  • Øyen, Tordis Beate; Jorde, A. T. & Kristensen, Tom Arne (2000). The iron-containing catalytic subunit of Pichia pastoris ribonucleotide reductase, RNR2.
  • Kristensen, Tom Arne (1999). Biokjemi - hva er vitsen?.
  • Kristensen, Tom Arne (1999). DNA polymerases in PCR and DNA sequencing.
  • Kristensen, Tom Arne (1999). DNA polymerases in PCR and DNA sequencing.
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Haraldsen, Ellen Christine; Yoshimura, Noriko; Lønning, Per Eystein; Erikstein, Bjørn; Kåresen, Rolf; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (1999). GENETIC POLYMORPHISMS OF CYP19 (AROMATASE), BREAST CANCER RISK AND CLINICAL AND HISTOPATHOLOGICAL PARAMETERS.
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Haraldsen, Ellen Christine; Yoshimura, Noriko; Lønning, Per Eystein; Erikstein, Bjørn; Kåresen, Rolf; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (1999). GENETIC POLYMORPHISMS OF CYP19 (AROMATASE), BREAST CANCER RISK AND CLINICAL AND HISTOPATHOLOGICAL PARAMETERS.
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Haraldsen, Ellen Christine; Yoshimura, Noriko; Lønning, Per Eystein; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (1999). GENETIC VARIANTS OF CYP19 (AROMATASE), mRNA LEVELS AND PUTATIVE STRUCTURE.
  • Kristensen, Vessela Nedelcheva; Harada, Nobuhiro; Haraldsen, Ellen Christine; Yoshimura, Noriko; Lønning, Per Eystein; Kristensen, Tom Arne & Børresen-Dale, Anne-Lise (1999). GENETIC VARIANTS OF CYP19 (AROMATASE), mRNA LEVELS AND PUTATIVE STRUCTURE OF THE TRANSCRIPT.
  • Tvermyr, Marianne; Kristiansen, Bjørn Evert & Kristensen, Tom Arne (1999). PROOFREADING ACTIVITY OF FAMILY A DNA POLYMERASES: THERE FROM THE BEGINNING. Vis sammendrag
  • Kristensen, Tom Arne (1998, 01. januar). Hva er bioinformatikk?. [Radio].  Forskning nr.7. : NRK.
  • Kristensen, Tom Arne (1997, 01. januar). Verdt å vite. [Radio].
  • Kristiansen, Bjørn Evert & Kristensen, Tom Arne (1997). Expression of Chloroflexus aurantiacus DNA polymerase I in Eschericia coli. There from the beginning?.
  • Rønneberg, J. A.; Kristensen, Tom Arne; Larsen, Frank & Bosnes, M. (1997). Optimalization of the Tth DNA polymerase reverse transcriptase activity for the use with Dynabeads (R).
  • Kristensen, Tom Arne (1996, 02. oktober). intervju. [Radio].  Verdt og vite, NRK.

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 4. nov. 2010 14:42 - Sist endret 26. mars 2019 13:03