Fritz Albregtsen

Bilde av Fritz Albregtsen
English version of this page
Telefon +47-22852463
Mobiltelefon +47-91163005
Rom 4459
Brukernavn
Besøksadresse Gaustadalléen 23B Ole-Johan Dahls hus 0373 OSLO
Postadresse Postboks 1080 Blindern 0316 OSLO

Faglige interesser

Jeg forsker mest på hvordan vi kan bruke kvantitativ bildeanalyse til å gi sikre prognoser for kreftpasienter. Dette gjør jeg sammen med egne Master- og PhD-studenter og kollegaer ved Radiumhospitalet. Data er digitale mikroskopibilder av cellekjerner fra pasientmaterialer som dekker flere krefttyper, og målet er å finne kompakte sett av adaptive tekstur-egenskaper i en høydimensjonal mengde av mulige egenskaper.

I tillegg arbeider jeg med kvantitative metrikker for bildekvalitet sammen med PhD-studenter og kollegaer ved Høgskolen i Gjøvik.

Undervisning

http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ifi/INF2310/

http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ifi/INF4300/

http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ifi/INF5300/

http://www.uio.no/studier/emner/matnat/ifi/INF-GEO4310/

Bakgrunn

Jeg har utdannings- og arbeidsbakgrunn fra teoretisk astrofysikk, men har vært ved Ifi siden 1983, og har arbeidet med medisinsk informatikk siden tidlig på 90-tallet.

 

Emneord: kvalitetsmetrikker, teksturanalyse, medisinsk informatikk, bildeanalyse

Publikasjoner

  • Kleppe, Andreas; Albregtsen, Fritz; Vlatkovic, Ljiljana; Pradhan, Manohar; Nielsen, Birgitte; Hveem, Tarjei Sveinsgjerd; Askautrud, Hanne Arenberg; Kristensen, Gunnar S Balle; Nesbakken, Arild; Trovik, Jone; Wæhre, Haakon; Tomlinson, Ian; Shepherd, Neil A.; Novelli, Marco; Kerr, David J. & Danielsen, Håvard Emil (2018). Chromatin organisation and cancer prognosis: a pan-cancer study. The Lancet Oncology.  ISSN 1470-2045.  19(3), s 356- 369 . doi: 10.1016/S1470-2045(17)30899-9
  • Kumar, Rahul Prasanna; Barkhatov, Leonid; Edwin, Bjørn; Albregtsen, Fritz & Elle, Ole Jakob (2017). Portal and hepatic vein segmentation with leak restriction: A pilot study. International Federation for Medical and Biological Engineering Proceedings.  ISSN 1680-0737.  65, s 823- 826 . doi: 10.1007/978-981-10-5122-7_206
  • Holmen, Sigve; Galappaththi-Arachchige, Hashini Nilushika; Kleppa, Elisabeth; Pillay, Pavitra; Naicker, Thajasvarie; Taylor, Myra; Onsrud, Mathias; Kjetland, Eyrun Floerecke & Albregtsen, Fritz (2016). Characteristics of Blood Vessels in Female Genital Schistosomiasis: Paving the Way for Objective Diagnostics at the Point of Care. PLoS Neglected Tropical Diseases.  ISSN 1935-2727.  10(4) . doi: 10.1371/journal.pntd.0004628
  • Hveem, Tarjei Sveinsgjerd; Kleppe, Andreas; Vlatkovic, Ljiljana; Ersvær, Elin; Wæhre, Haakon; Nielsen, Birgitte; Kjær, Marte Avranden; Pradhan, Manohar; Syvertsen, Rolf Anders; Nesheim, John Arne; Liestøl, Knut; Albregtsen, Fritz & Danielsen, Håvard Emil (2016). Chromatin changes predict recurrence after radical prostatectomy. British Journal of Cancer.  ISSN 0007-0920.  114(11), s 1243- 1250 . doi: 10.1038/bjc.2016.96
  • Hveem, Tarjei Sveinsgjerd; Njølstad, Tormund Salvesen; Nielsen, Birgitte; Syvertsen, Rolf Anders; Nesheim, John Arne; Kjæreng, Marna Lill; Kildal, Wanja; Pradhan, Manohar; Marcickiewicz, Janusz; Tingulstad, Solveig; Staff, Anne Cathrine; Haugland, Hans Kristian; Eraker, Runar; Oddenes, Klaus; Rokne, Jan Anders; Tjugum, Jostein; Lode, Margaret Sævik; Amant, Frédéric; Werner, Henrica Maria Johanna; Bjørge, Line; Albregtsen, Fritz; Liestøl, Knut; Salvesen, Helga; Trovik, Jone & Danielsen, Håvard Emil (2016). Changes in Chromatin Structure in Curettage Specimens Identifies High-Risk Patients in Endometrial Cancer. Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention.  ISSN 1055-9965.  26(1), s 61- 67 . doi: 10.1158/1055-9965.EPI-16-0215
  • Holmen, Sigve; Kjetland, Eyrun Floerecke; Taylor, Myra; Kleppa, Elisabeth; Lillebø, Kristine; Gundersen, Svein Gunnar; Onsrud, Mathias & Albregtsen, Fritz (2015). Colourimetric image analysis as a diagnostic tool in female genital schistosomiasis. Medical Engineering and Physics.  ISSN 1350-4533.  37(3), s 309- 314 . doi: 10.1016/j.medengphy.2014.12.007
  • Holmen, Sigve; Kleppa, Elisabeth; Lillebø, Kristine; Pillay, Pavitra; Van Lieshout, Lisette; Taylor, Myra; Albregtsen, Fritz; Vennervald, Birgitte Jyding; Onsrud, Mathias & Kjetland, Eyrun Floerecke (2015). The first step toward diagnosing female genital schistosomiasis by computer image analysis. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene.  ISSN 0002-9637.  93(1), s 80- 86 . doi: 10.4269/ajtmh.15-0071
  • Kumar, Rahul Prasanna; Albregtsen, Fritz; Reimers, Martin; Edwin, Bjørn; Langø, Thomas & Elle, Ole Jakob (2015). Blood vessel segmentation and centerline tracking using local structure analysis. International Federation for Medical and Biological Engineering Proceedings.  ISSN 1680-0737.  45, s 122- 125 . doi: 10.1007/978-3-319-11128-5_31 Vis sammendrag
  • Kumar, Rahul Prasanna; Albregtsen, Fritz; Reimers, Martin; Edwin, Bjørn; Langø, Thomas & Elle, Ole Jakob (2015). Three-Dimensional Blood Vessel Segmentation and Centerline Extraction based on Two-Dimensional Cross-Section Analysis. Annals of Biomedical Engineering.  ISSN 0090-6964.  43(5), s 1223- 1234 . doi: 10.1007/s10439-014-1184-4 Vis sammendrag
  • Landmark, Knut; Solberg, Anne H Schistad; Albregtsen, Fritz; Austeng, Andreas & Hansen, Roy Edgar (2015). A Radon-Transform-Based Image Noise Filter - With Applications to Multibeam Bathymetry. IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing.  ISSN 0196-2892.  53(11), s 6252- 6273 . doi: 10.1109/TGRS.2015.2436380

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 4. nov. 2010 13:43 - Sist endret 6. jan. 2014 11:53

Prosjekter

Ingen pågående prosjekter