Gaute Tomas Einevoll

• Koivumäki, Jussi T.; Hoffman, Johan; Maleckar, Mary Margot Catherine; Einevoll, Gaute & Sundnes, Joakim (2022). Computational cardiac physiology for new modelers: Origins, foundations, and future. Acta Physiologica. ISSN 1748-1708. doi: 10.1111/apha.13865.
• Hagen, Espen; Magnusson, Steinn H.; Ness, Torbjørn Vefferstad; Halnes, Geir; Babu, Pooja N. & Linssen, Charl [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2022). Brain signal predictions from multi-scale networks using a linearized framework. PLoS Computational Biology. ISSN 1553-734X. doi: 10.1371/journal.pcbi.1010353. Fulltekst i vitenarkiv
• Valstad, Mathias; Roelfs, Daniel; Slapø, Nora Berz; Timpe, Clara Marie Fides; Rai, Ahsan & Matziorinis, Anna Maria [Vis alle 24 forfattere av denne artikkelen] (2021). Evidence for Reduced Long-Term Potentiation-Like Visual Cortical Plasticity in Schizophrenia and Bipolar Disorder. Schizophrenia Bulletin. ISSN 0586-7614. 47(6), s. 1751–1760. doi: 10.1093/schbul/sbab049. Fulltekst i vitenarkiv
• Sætra, Marte Julie; Einevoll, Gaute & Halnes, Geir (2021). An electrodiffusive neuron-extracellular-glia model for exploring the genesis of slow potentials in the brain. PLoS Computational Biology. ISSN 1553-734X. 17(7). doi: 10.1371/journal.pcbi.1008143. Fulltekst i vitenarkiv
• Born, Gregory; Schneider-Soupiadis, Felix A.; Erisken, Sinem; Vaiceliunaite, Agne; Lao, Chu Lan & Mobarhan, Milad [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2021). Corticothalamic feedback sculpts visual spatial integration in mouse thalamus. Nature Neuroscience. ISSN 1097-6256. 24, s. 1711–1720. doi: 10.1038/s41593-021-00943-0.
• Martínez-Cañada, Pablo; Ness, Torbjørn V; Einevoll, Gaute; Fellin, Tommaso & Panzeri, Stefano (2021). Computation of the electroencephalogram (EEG) from network models of point neurons. PLoS Computational Biology. ISSN 1553-734X. 17(4). doi: 10.1371/JOURNAL.PCBI.1008893. Fulltekst i vitenarkiv
• Puppo, Francesca; Sadegh, Sanaz; Trujillo, Cleber A.; Thunemann, Martin; Campbell, Evan P. & Vandenberghe, Matthieu [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2021). All-Optical Electrophysiology in hiPSC-Derived Neurons With Synthetic Voltage Sensors. Frontiers in Cellular Neuroscience. ISSN 1662-5102. 15. doi: 10.3389/fncel.2021.671549. Fulltekst i vitenarkiv
• Hagen, Espen; Chambers, Anna; Einevoll, Gaute; Pettersen, Klas Henning; Enger, Rune & Stasik, Alexander Johannes (2021). RippleNet: a Recurrent Neural Network for Sharp Wave Ripple (SPW-R) Detection. Neuroinformatics. ISSN 1539-2791. 19, s. 493–514. doi: 10.1007/s12021-020-09496-2. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag

  Hippocampal sharp wave ripples (SPW-R) have been identified as key bio-markers of important brain functions such as memory consolidation and decision making. Understanding their underlying mechanisms in healthy and pathological brain function and behaviour rely on accurate SPW-R detection. In this multidisciplinary study, we propose a novel, self-improving artificial intelligence (AI) detection method in the form of deep Recurrent Neural Networks (RNN) with Long Short-Term memory (LSTM) layers that can learn features of SPW-R events from raw, labeled input data. The approach contrasts conventional routines that typically relies on hand-crafted, heuristic feature extraction and often laborious manual curation. The algorithm is trained using supervised learning on hand-curated data sets with SPW-R events obtained under controlled conditions. The input to the algorithm is the local field potential (LFP), the low-frequency part of extracellularly recorded electric potentials from the CA1 region of the hippocampus. Its output predictions can be interpreted as time-varying probabilities of SPW-R events for the duration of the inputs. A simple thresholding applied to the output probabilities is found to identify times of SPW-R events with high precision. The non-causal, or bidirectional variant of the proposed algorithm demonstrates consistently better accuracy compared to the causal, or unidirectional counterpart. Reference implementations of the algorithm, named ‘RippleNet’, are open source, freely available, and implemented using a common open-source framework for neural networks (tensorflow.keras) and can be easily incorporated into existing data analysis workflows for processing experimental data.

• Næss, Solveig; Halnes, Geir; Hagen, Espen; Hagler, Donald J.; Dale, Anders M. & Einevoll, Gaute [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2021). Biophysically detailed forward modeling of the neural origin of EEG and MEG signals. NeuroImage. ISSN 1053-8119. 225. doi: 10.1016/j.neuroimage.2020.117467. Fulltekst i vitenarkiv
• Fomin-Thunemann, Natalie; Mächler, Philipp; Sætra, Marte Julie; Thunemann, Martin; Desjardins, Michèle & Saisan, Payam [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2020). Estimation of cortical oxygen metabolism in awake mice using two-photon imaging of oxyphor 2p. Biomedical Optics 2020. doi: 10.1364/BRAIN.2020.BTu4C.5.
• Valstad, Mathias; Moberget, Torgeir; Roelfs, Daniël Thomas Heimen; Slapø, Nora Berz; Timpe, Clara Marie Fides & Beck, Dani [Vis alle 18 forfattere av denne artikkelen] (2020). Experience-dependent modulation of the visual evoked potential: Testing effect sizes, retention over time, and associations with age in 415 healthy individuals. NeuroImage. ISSN 1053-8119. doi: 10.1016/j.neuroimage.2020.117302. Fulltekst i vitenarkiv
• Sætra, Marte Julie; Solbrå, Andreas Våvang; Devor, Anna; Sakadžić, Sava; Dale, Anders M. & Einevoll, Gaute (2020). Spatially Resolved Estimation of Metabolic Oxygen Consumption From Optical Measurements in Cortex. Neurophotonics. ISSN 2329-423X. 7(3). doi: 10.1117/1.NPh.7.3.035005. Fulltekst i vitenarkiv
• Ness, Torbjørn Vefferstad; Halnes, Geir; Næss, Solveig; Pettersen, Klas Henning & Einevoll, Gaute (2020). Computing extracellular electric potentials from neuronal simulations. arXiv.org. ISSN 2331-8422.
• Næss, Solveig; Halnes, Geir; Hagen, Espen; Hagler, Donald J.; Dale, Anders M. & Einevoll, Gaute [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2020). Biophysical modeling of the neural origin of EEG and MEG signals. BioRxiv. ISSN 0362-4331. doi: 10.1101/2020.07.01.181875.
• Hagen, Espen; Chambers, Anna; Einevoll, Gaute; Pettersen, Klas Henning; Enger, Rune & Stasik, Alexander Johannes (2020). RippleNet: A Recurrent Neural Network for Sharp Wave Ripple (SPW-R) Detection. bioRxiv - the preprint server for biology. doi: 10.1101/2020.05.11.087874. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag

  Hippocampal sharp wave ripples (SPW-R) have been identified as key bio-markers of important brain functions such as memory consolidation and decision making. SPW-R detection typically relies on hand-crafted feature extraction, and laborious manual curation is often required. In this multidisciplinary study, we propose a novel, self-improving artificial intelligence (AI) method in the form of deep Recurrent Neural Networks (RNN) with Long Short-Term memory (LSTM) layers that can learn features of SPW-R events from raw, labeled input data. The algorithm is trained using supervised learning on hand-curated data sets with SPW-R events. The input to the algorithm is the local field potential (LFP), the low-frequency part of extracellularly recorded electric potentials from the CA1 region of the hippocampus. The output prediction can be interpreted as the time-varying probability of SPW-R events for the duration of the input. A simple thresholding applied to the output probabilities is found to identify times of events with high precision. The reference implementation of the algorithm, named ‘RippleNet’, is open source, freely available, and implemented using a common open-source framework for neural networks (tensorflow.keras) and can be easily incorporated into existing data analysis workflows for processing experimental data.

• Dai, Kael; Gratiy, Sergey L.; Billeh, Yazan; Xu, Richard; Cai, Binghuang & Cain, Nicholas [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2020). Brain Modeling ToolKit: An open source software suite for multiscale modeling of brain circuits. PLoS Computational Biology. ISSN 1553-734X. 16(11). doi: 10.1371/journal.pcbi.1008386. Fulltekst i vitenarkiv
• Geddes, Justen; Einevoll, Gaute; Acar, Evrim & Stasik, Alexander Johannes (2020). Multi-Linear Population Analysis (MLPA) of LFP Data Using Tensor Decompositions. Frontiers in Applied Mathematics and Statistics. ISSN 2297-4687. doi: 10.3389/fams.2020.00041. Fulltekst i vitenarkiv
• Mäki-Marttunen, Tuomo; Iannella, Nicolangelo Libero; Edwards, Andrew; Einevoll, Gaute & Blackwell, Kim T. (2020). A unified computational model for cortical post-synaptic plasticity. eLIFE. ISSN 2050-084X. 9, s. 1–37. doi: 10.7554/eLife.55714. Fulltekst i vitenarkiv
• Buccino, Alessio Paolo & Einevoll, Gaute (2020). MEArec: A fast and customizable testbench simulator for ground-truth extracellular spiking activity. Neuroinformatics. ISSN 1539-2791. 19, s. 185–204. doi: 10.1007/s12021-020-09467-7. Fulltekst i vitenarkiv
• Ellingsrud, Ada Johanne; Solbrå, Andreas Våvang; Einevoll, Gaute; Halnes, Geir & Rognes, Marie Elisabeth (2020). Finite element simulation of ionic electrodiffusion in cellular geometries. Frontiers in Neuroinformatics. ISSN 1662-5196. 14, s. 1–18. doi: 10.3389/fninf.2020.00011. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i Cristin

• Haugen, Kjetil K.; Solberg, Harry Arne; Sætre, Irene Lange; Loktu, Morten; Guvåg, Bjørn & Owren, Brynjulf [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2022). Fra toppen av Haugen : årets vinner er fra NTNU. Panorama : nettavis for Høgskolen i Molde.
• Einevoll, Gaute (2021). Towards multipurpose biophysics-based mathematical models of cortical circuits.
• Einevoll, Gaute (2021). Modeling EEG Signals From the Bottom Up.
• Einevoll, Gaute (2021). Fysikernes tid.
• Einevoll, Gaute (2021). Live-streamet intervju for NMBU Alumnni: Hvorfor var vi så uforberedt på pandemien?
• Einevoll, Gaute (2021). Nå er det på tide at vi kommer oss ut i verdensrommet. [Internett]. forskning.no.
• Einevoll, Gaute (2021). Derfor kom pandemien så overraskende på oss. [Internett]. forskning.no.
• Einevoll, Gaute (2021). Intervju i Min Hjernehelse, et magasin fra Hjernerådet: Vil du også bli hjerneforsker? . [Fagblad]. Min Hjernehelse.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i podcasten Hjernepodden. [Internett]. Podcast.
• Einevoll, Gaute & Kvellestad, Anders (2021). Podcast #34: Om kvantefysikk og hvordan den skal forstås. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Brekke, Pål (2021). Podcast #35: Om nordlys og Kristian Birkeland. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Koch, Christof (2021). Podcast #36: On consciousness. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Sverdrup-Thygeson, Anne (2021). Podcast #37: Om naturkrisa. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grønn, Atle (2021). Podcast #38: Om sjakk. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grødeland, Gunnveig (2021). Podcast #39: Om status for koronavaksiner. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Hesselberg, Jan-Ole (2021). Podcast #40: Om å ta beslutninger. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Røislien, Jo (2021). Podcast #41: Om statistikk, liv og vitenskapsformidling. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Raklev, Are (2021). Podcast #42: Om nye fysikkpartikler. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Nilsen, Hilde (2021). Podcast #43: Om å stoppe aldring. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Kvam, Tor-Morten (2021). Podcast #44: Om psykedelika i behandling av psykiske lidelser. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Hessen, Dag Olav (2021). Podcast #45: Om verdens vippepunkter. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grøn, Øyvind (2021). Podcast #46: Om sorte hull. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Samset, Bjørn Hallvard (2021). Podcast #47: Om klimakrisen. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Stoknes, Per Espen (2021). Podcast #48: Om grønn vekst. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute; Tindberg, Svein; Bang-Hansen, Kjetil; Raklev, Are & Kvellestad, Anders (2021). Podcast #49: Om det er mulig å tro på Gud og vitenskap samtidig. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute (2021). Intervju i NRK1, Dagsnytt 18. [TV]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Abels Tårn, NRK P2. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Abels Tårn, NRK P2. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Ukeslutt, NRK P1. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Abels Tårn, NRK P2. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Abels forgård, NRK P2. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2021). Deltagelse i Abels Tårn. [Radio]. NRK.
• Bjorå, Charlotte Sletten; Einevoll, Gaute; Ellingsen-Dalskau, Kristian & Jemterud, Torkild (2021). Abels tårn. [Radio]. NRK P2.
• Kaufmann, Mareile; Syse, Henrik; Einevoll, Gaute & Sandvik, Kristin Bergtora (2020). Digital Brains: Neuroscience, Philosophy and Law in Conversation.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i podcasten Romkapsel. [Internett]. Podcast.
• Einevoll, Gaute & Pettersen, Klas Henning (2020). Deltagelse i podcasten NORDE. [Internett]. Podcast.
• Einevoll, Gaute & Pettersen, Klas Henning (2020). Deltagelse i podcasten NORDE. [Internett]. Podcast.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltager i podcasten Teknokratiet. [Internett]. Podcast: Teknokratiet.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i Abels Tårn. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i Abels Tårn. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i Reiseradioen. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i Abels Tårn. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i Abels Tårn. [Radio]. NRK.
• Einevoll, Gaute (2020). Tar mikrofonen i egne hender. [Fagblad]. Forskerforum.
• Einevoll, Gaute (2020). Nei, det er ingen krise i fysikken. [Internett]. forskning.no.
• Einevoll, Gaute (2020). Digital brains are key in understanding how the human brain works, and how it can be fixed when broken. [Internett]. Science Norway.
• Einevoll, Gaute (2020). Det har aldri vært mer aktuelt med en norsk astronaut enn n ̊a. [Fagblad]. Tekna Magasinet.
• Einevoll, Gaute (2020). Kan du tenke deg tynn? [Internett]. forskning.no.
• Einevoll, Gaute (2020). Kan hjernen gå tom for plass? [Internett]. forskning.no.
• Einevoll, Gaute (2020). Deltagelse i UNGFORSK,Vitenparken/NMBU (virtual).
• Einevoll, Gaute (2020). Kan vi regne ut hvordan vi tenker?
• Einevoll, Gaute (2020). Towards a multipurpose cortical network model.
• Einevoll, Gaute (2020). Towards multipurpose biophysics-based mathematical models of cortical circuits.
• Einevoll, Gaute (2020). Towards multipurpose biophysics-based mathematical models of cortical circuits.
• Einevoll, Gaute (2020). Towards multipurpose biophysics-based mathematical models of cortical circuits.
• Einevoll, Gaute & Rose, Sunniva (2020). Om kjernekraft og forskningsformiding. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Newth, Eirik (2020). Om romfart. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute; Samset, Bjørn Hallvard; Sverdrup-Thygeson, Anne; Svihus, Birger; Østby, Hilde & Røyne, Anja [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2020). Om å gi alle jordas mennesker gode liv uten å ødelegge miljøet. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Sejnowski, Terrence J. (2020). On AI and the underlying algorithms . [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Samset, Bjørn Hallvard (2020). Om klimafysikk. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Nyborg, Karine (2020). Om klimaøkonomi. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Carroll, Sean M (2020). On the physics world view and the interpretation of quantum mechanics. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Elgarøy, Øystein (2020). Om universet og Big Bang teorien. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Lönn-Stensrud, Jessica (2020). Om bakterier. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Østby, Hilde (2020). Om kreativitet. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & McFadden, Johnjoe (2020). On quantum biology. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Raklev, Are (2020). Om partikkelfysikk og jakten på Higgs-bosonet. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Støstad, Hanna Nyborg (2020). Om evolusjonsteorien og naturens mangfold. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Egeland, Kjølv (2020). Om faren for atomkrig. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grøn, Øyvind (2020). Om Einstein og relativitetsteoriene hans. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grøn, Øyvind (2020). Om Einstein og resten av fysikken hans. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute; Bjaalie, Jan G. & Plesser, Hans Ekkehard (2020). Om hjerneforskning og Human Brain Project . [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute; Tunstad, Erik & Riiser-Larsen, Vibeke (2020). Om neandertalerne. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Grødeland, Gunnveig (2020). Om vaksiner, spesielt koronavaksiner. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Røyne, Anja (2020). Om løsninger på klimakrisen. [Internett]. Podcast: Vett og vitenskap med Gaute Einevoll.
• Einevoll, Gaute & Spurkland, Anne (2020). Om koronaviruset – Med Anne Spurkland #14. [Internett]. Vett og Viten.
• Einevoll, Gaute & Spurkland, Anne (2020). Om coronaviruset. En oppdatering – med Anne Spurkland #21. [Internett]. Vett og Viten.
• Einevoll, Gaute (2020). Why model brain signals?
• Einevoll, Gaute (2020). Leveraging data, tools and models to gain new insights in mouse visual cortex.
• Iannella, Nicolangelo Libero; Prydz, Kristian; Malthe-Sørensen, Anders; Einevoll, Gaute & Fyhn, Marianne (2020). A framework for modelling neuronal-ECM signalling.

Se alle arbeider i Cristin