Annihilasjon er ikke det samme som henfall, men også annihilasjon foregår ved hjelp av virtuelle partikler. I en annihilasjon går en partikkel og en antipartikkel over til ren energi.

Det vil si at de vekselvirker med hverandre slik at all energien de hadde blir overført til en energetisk kraftbærende partikkel (et gluon, en W eller Z, eller et foton). Denne kraftbærende partikkelen går så over til andre partikler igjen.
Ofte lar fysikere en partikkel og en antipartikkel, begge med høy energi, annihilere for derved å kunne skape nye, tunge partikler.