Ole Kristian Tørresen

Bilde av Ole Kristian Tørresen
English version of this page
Brukernavn
Besøksadresse Blindernveien 31 0371 Oslo
Postadresse Postboks 1066 Blindern 0316 Oslo

Faglige interesser

Genomevolusjon, evolusjon og biologi generelt.

 

Publikasjoner

  • Nilsson, Pernille; Solbakken, Monica Hongrø; Schmid, Boris Valentijn; Orr, Russell; Lv, Ruichen & Cui, Yujun [Vis alle 14 forfattere av denne artikkelen] (2020). The Genome of the Great Gerbil Reveals Species-Specific Duplication of an MHCII Gene. Genome Biology and Evolution (GBE). ISSN 1759-6653. 12(2), s. 3832–3849. doi: 10.1093/gbe/evaa008. Fulltekst i vitenarkiv
  • Barth, Julia Maria Isis; Gubili, Chrysoula; Matschiner, Michael; Tørresen, Ole K.; Watanabe, Shun & Egger, Bernd [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2020). Stable species boundaries despite ten million years of hybridization in tropical eels. Nature Communications. ISSN 2041-1723. 11. doi: 10.1038/s41467-020-15099-x. Fulltekst i vitenarkiv
  • Roth, Olivia; Solbakken, Monica Hongrø; Tørresen, Ole K.; Bayer, Till; Matschiner, Michael & Baalsrud, Helle Tessand [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2020). Evolution of male pregnancy associated with remodeling of canonical vertebrate immunity in seahorses and pipefishes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ISSN 0027-8424. 117(17), s. 9431–9439. doi: 10.1073/pnas.1916251117.
  • Jin, Xingkun; Morro, Bernat; Tørresen, Ole K.; Moiche, Visila; Solbakken, Monica Hongrø & Jakobsen, Kjetill Sigurd [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2020). Innovation in Nucleotide-Binding Oligomerization-Like Receptor and Toll-Like Receptor Sensing Drives the Major Histocompatibility Complex-II Free Atlantic Cod Immune System. Frontiers in Immunology. ISSN 1664-3224. 11. doi: 10.3389/fimmu.2020.609456.
  • Cayuela, Hugo; Rougemont, Quentin; Laporte, Martin; Mérot, Claire; Normandeau, Eric & Dorant, Yann [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2020). Shared ancestral polymorphism and chromosomal rearrangements as potential drivers of local adaptation in a marine fish. Molecular Ecology. ISSN 0962-1083. 29, s. 2379–2398. doi: 10.1111/mec.15499.
  • Tørresen, Ole K.; Star, Bastiaan; Mier, Pablo; Andrade-Navarro, Miguel A.; Bateman, Alex & Jarnot, Patryk [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2019). Tandem repeats lead to sequence assembly errors and impose multi-level challenges for genome and protein databases. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 47(21), s. 10994–11006. doi: 10.1093/nar/gkz841. Fulltekst i vitenarkiv
  • Musilova, Zuzana; Cortesi, Fabio; Matschiner, Michael; Davies, Wayne I. L.; Patel, Jagdish Suresh & Stieb, Sara M. [Vis alle 18 forfattere av denne artikkelen] (2019). Vision using multiple distinct rod opsins in deep-sea fishes. Science. ISSN 0036-8075. 364(6440), s. 588–592. doi: 10.1126/science.aav4632.
  • Tørresen, Ole K.; Brieuc, Marine Servane; Solbakken, Monica Hongrø; Sørhus, Elin; Nederbragt, Alexander Johan & Jakobsen, Kjetill Sigurd [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2018). Genomic architecture of haddock (Melanogrammus aeglefinus) shows expansions of innate immune genes and short tandem repeats. BMC Genomics. ISSN 1471-2164. 19(240), s. 1–17. doi: 10.1186/s12864-018-4616-y. Fulltekst i vitenarkiv
  • Machado, Andrè M.; Tørresen, Ole K.; Kabeya, Naoki; Couto, Alvarina; Petersen, Bent & Felício, Mónica [Vis alle 17 forfattere av denne artikkelen] (2018). “Out of the Can”: A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus. Genes. ISSN 2073-4425. 9(10), s. 1–13. doi: 10.3390/genes9100485. Fulltekst i vitenarkiv
  • Varadharajan, Srinidhi; Sandve, Simen Rød; Gillard, Gareth Benjamin; Tørresen, Ole K.; Mulugeta, Teshome Dagne & Hvidsten, Torgeir Rhoden [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2018). The grayling genome reveals selection on gene expression regulation after whole-genome duplication. Genome Biology and Evolution (GBE). ISSN 1759-6653. 10(10), s. 2785–2800. doi: 10.1093/gbe/evy201. Fulltekst i vitenarkiv
  • Eide, Marta; Rydbeck, Halfdan; Tørresen, Ole K.; Lille-Langøy, Roger; Puntervoll, Pål & Goldstone, Jared V. [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2018). Independent losses of a xenobiotic receptor across teleost evolution. Scientific Reports. ISSN 2045-2322. 8, s. 1–13. doi: 10.1038/s41598-018-28498-4. Fulltekst i vitenarkiv
  • Malmstrøm, Martin; Britz, Ralf; Matschiner, Michael; Tørresen, Ole K.; Hadiaty, Renny Kurnia & Yaakob, Norsham [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2018). The Most Developmentally Truncated Fishes Show Extensive Hox Gene Loss and Miniaturized Genomes. Genome Biology and Evolution (GBE). ISSN 1759-6653. 10(4), s. 1088–1103. doi: 10.1093/gbe/evy058. Fulltekst i vitenarkiv
  • Lie, Kai Kristoffer; Tørresen, Ole K.; Solbakken, Monica Hongrø; Rønnestad, Ivar; Tooming-Klunderud, Ave & Nederbragt, Alexander Johan [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2018). Loss of stomach, loss of appetite? Sequencing of the ballan wrasse (Labrus bergylta) genome and intestinal transcriptomic profiling illuminate the evolution of loss of stomach function in fish. BMC Genomics. ISSN 1471-2164. 19(186), s. 1–17. doi: 10.1186/s12864-018-4570-8. Fulltekst i vitenarkiv
  • Mattingsdal, Morten; Jentoft, Sissel; Tørresen, Ole K.; Knutsen, Halvor; Hansen, Michael Möller & Robalo, Joana I. [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2018). A continuous genome assembly of the corkwing wrasse (Symphodus melops). Genomics. ISSN 0888-7543. 110(6), s. 399–403. doi: 10.1016/j.ygeno.2018.04.009.
  • Hoff, Siv Nam Khang; Baalsrud, Helle Tessand; Tooming-Klunderud, Ave; Skage, Morten; Richmond, Todd & Obernosterer, Gregor [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2018). Long‐read sequence capture of the haemoglobin gene clusters across codfish species. Molecular Ecology Resources. ISSN 1755-098X. 19(1), s. 245–259. doi: 10.1111/1755-0998.12955.
  • Elgvin, Tore Oldeide; Trier, Cassandra Nicole; Tørresen, Ole Kristian; Hagen, Ingerid; Lien, Sigbjørn & Nederbragt, Alexander Johan [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2017). The genomic mosaicism of hybrid speciation. Science Advances. ISSN 2375-2548. 3, s. 1–16. doi: 10.1126/sciadv.1602996. Fulltekst i vitenarkiv
  • Tørresen, Ole Kristian; Star, Bastiaan; Jentoft, Sissel; Reinar, William Brynildsen; Grove, Harald & Miller, Jason R. [Vis alle 16 forfattere av denne artikkelen] (2017). An improved genome assembly uncovers prolific tandem repeats in Atlantic cod. BMC Genomics. ISSN 1471-2164. 18, s. 1–23. doi: 10.1186/s12864-016-3448-x. Fulltekst i vitenarkiv
  • Malmstrøm, Martin; Matschiner, Michael; Tørresen, Ole Kristian; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Jentoft, Sissel (2017). Whole genome sequencing data and de novo draft assemblies for 66 teleost species. Scientific Data. ISSN 2052-4463. 4, s. 1–13. doi: 10.1038/sdata.2016.132. Fulltekst i vitenarkiv
  • Baalsrud, Helle Tessand; Tørresen, Ole Kristian; Solbakken, Monica Hongrø; Salzburger, Walter; Hanel, Reinhold & Jakobsen, Kjetill Sigurd [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2017). De Novo Gene Evolution of Antifreeze Glycoproteins in Codfishes Revealed by Whole Genome Sequence Data. Molecular Biology and Evolution (MBE). ISSN 0737-4038. 35(3), s. 593–606. doi: 10.1093/molbev/msx311. Fulltekst i vitenarkiv
  • Baalsrud, Helle Tessand; Voje, Kjetil L.; Tørresen, Ole Kristian; Solbakken, Monica Hongrø; Matschiner, Michael & Malmstrøm, Martin [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2017). Evolution of Hemoglobin Genes in Codfishes Influenced by Ocean Depth. Scientific Reports. ISSN 2045-2322. 7, s. 1–10. doi: 10.1038/s41598-017-08286-2. Fulltekst i vitenarkiv
  • Malmstrøm, Martin; Matschiner, Michael; Tørresen, Ole Kristian; Star, Bastiaan; Snipen, Lars-Gustav & Hansen, Thomas F [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2016). Evolution of the immune system influences speciation rates in teleost fishes. Nature Genetics. ISSN 1061-4036. 48(10), s. 1204–1210. doi: 10.1038/ng.3645. Fulltekst i vitenarkiv
  • Star, Bastiaan; Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan; Jakobsen, Kjetill Sigurd; Pampoulie, Christophe & Jentoft, Sissel (2016). Genomic characterization of the Atlantic cod sex-locus. Scientific Reports. ISSN 2045-2322. 6, s. 1–9. doi: 10.1038/srep31235. Fulltekst i vitenarkiv
  • Solbakken, Monica Hongrø; Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan; Seppola, Marit; Gregers, Tone Fredsvik & Jakobsen, Kjetill Sigurd [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2016). Evolutionary redesign of the Atlantic cod (Gadus morhua L.) Toll-like receptor repertoire by gene losses and expansions. Scientific Reports. ISSN 2045-2322. 6. doi: 10.1038/srep25211. Fulltekst i vitenarkiv
  • Tørresen, Ole Kristian; Rise, Matthew L.; Jin, Xingkun; Star, Bastiaan; MacKenzie, Simon & Jakobsen, Kjetill Sigurd [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2016). An improved version of the Atlantic cod genome and advancements in functional genomics: implications for the future of cod farming. I MacKenzie, Simon & Jentoft, Sissel (Red.), Genomics in Aquaculture. Elsevier. ISSN 9780128014189. s. 45–72. doi: 10.1016/B978-0-12-801418-9.00003-2.
  • Tørresen, Ole Kristian; Star, Bastiaan; Jentoft, Sissel; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Nederbragt, Alexander Johan (2016). The new era of genome sequencing using high-throughput sequencing technology: Generation of the first version of the Atlantic cod genome. I MacKenzie, Simon & Jentoft, Sissel (Red.), Genomics in Aquaculture. Elsevier. ISSN 9780128014189. s. 1–20. doi: 10.1016/B978-0-12-801418-9.00001-9.
  • Cortesi, Fabio; Musilováa, Zuzana; Stieb, Sara M.; Hart, Nathan S.; Siebeck, Ulrike E. & Malmstrøm, Martin [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2015). Ancestral duplications and highly dynamic opsin gene evolution in percomorph fishes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ISSN 0027-8424. 112(5), s. 1493–1498. doi: 10.1073/pnas.1417803112.
  • Minge, Marianne Aastebøl; Shalchian-Tabrizi, Kamran; Tørresen, Ole Kristian; Takishita, Kiyotaka; Probert, Ian & Inagaki, Yuji [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2010). A phylogenetic mosaic plastid proteome and unusual plastid-targeting signals in the green-colored dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum. BMC Evolutionary Biology. ISSN 1471-2148. 10. doi: 10.1186/1471-2148-10-191. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i Cristin

  • Tørresen, Ole K. (2018). De novo genome assemblies of Atlantic cod.
  • Reinar, William Brynildsen; Tørresen, Ole K.; Matschiner, Michael; Jentoft, Sissel; Nederbragt, Alexander Johan & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2018). The impact of repetitive DNA on speciation rates in teleost fish.
  • Tørresen, Ole K.; Skrede, Inger; Sandve, Simen Rød; Jentoft, Sissel; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Borge, Ole Johan (2018). Gendykk i norsk natur gir ny kunnskap. Genialt. ISSN 0804-225X. s. 16–18.
  • Tørresen, Ole K. (2017). Long reads: dream or reality?
  • Eide, Marta; Puntervoll, Pål; Lille-Langøy, Roger; Goldstone, Jared V.; Tørresen, Ole Kristian & Nederbragt, Alexander Johan [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2016). Chemical warfare in the marine environment: genomic survey of the Atlantic cod (Gadus morhua) defensome reveals the absence of an important xenosensor.
  • Baalsrud, Helle Tessand; Tørresen, Ole Kristian; Malmstrøm, Martin; Salzburger, Walter; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Jentoft, Sissel (2015). The hemoglobin repertoire in the order of Gadiformes linked to depth adaptation.
  • Tørresen, Ole Kristian; Walenz, Brian; Grove, Harald; Lien, Sigbjørn; Knight, James & Star, Bastiaan [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2014). A new, high quality reference genome assembly for Atlantic cod.
  • Matschiner, Michael; Star, Bastiaan; Berg, Paul Ragnar; Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan & Hansen, Marianne Helén Selander [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2014). Population differentiation and local adaptation in Atlantic cod.
  • Brynildsen, William; Tørresen, Ole Kristian; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Nederbragt, Alexander Johan (2014). Genomic sequence repeats in fish genomes.
  • Elgvin, Tore Oldeide; Trier, Cassandra Nicole; Tørresen, Ole Kristian; Lien, Sigbjørn; Jensen, Henrik & Sætre, Glenn-Peter (2014). Sparrows, scaffolds and pseudo-chromosomes.
  • Tørresen, Ole Kristian; Jentoft, Sissel; Star, Bastiaan; Sandve, Geir Kjetil F.; Skage, Morten & Hansen, Marianne Helén Selander [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2014). A new, high quality reference genome assembly for Atlantic cod.
  • Nederbragt, Alexander Johan; Walenz, Brian; Tørresen, Ole Kristian; Jentoft, Sissel; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Miller, Jason Rafe (2014). Towards correction-free assembly of raw PacBio reads.
  • Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan; Miller, Jason Rafe; Walenz, Brian; Jentoft, Sissel & Jakobsen, Kjetill Sigurd (2013). Improving the Atlantic cod genome using long-read PacBio in combination with 454 and Illumina sequencing data.
  • Solbakken, Monica Hongrø; Malmstrøm, Martin; Tørresen, Ole Kristian; Jakobsen, Kjetill Sigurd & Jentoft, Sissel (2013). Atlantic cod displays an unusual TLR repertoire – a Gadidae-specific feature?
  • Tørresen, Ole Kristian (2013). Improving the cod genome assembly: Combining assembly programs and different types of sequencing data.
  • Tørresen, Ole Kristian; Nederbragt, Alexander Johan; Lagesen, Karin; Khelik, Ksenia; Rognes, Torbjørn & Jentoft, Sissel [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2012). Improving the cod genome with the use of multi-platform sequencing data.
  • Nederbragt, Alexander Johan; Tørresen, Ole Kristian; Khelik, Ksenia; Lagesen, Karin; Rounge, Trine Ballestad & Star, Bastiaan [Vis alle 13 forfattere av denne artikkelen] (2012). Challenges and Opportunities for Improving the Atlantic Cod Genome Assembly and Annotation.
  • Nederbragt, Alexander Johan; Tørresen, Ole Kristian; Skage, Morten; Tooming-Klunderud, Ave ; Hansen, Marianne Helén Selander & Jentoft, Sissel [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2012). The long jump: Long distance mate pairs and long PacBio reads for the Salmon Genome Project.

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 26. jan. 2018 11:55 - Sist endret 11. mai 2020 08:24