Milena Pavlovic
Postdoktor
-
Vitenskapelige beregninger og maskinlæring
English version of this page
Brukernavn
Besøksadresse
Gaustadalléen 23B
Ole Johan Dahls hus
0373 Oslo
Postadresse
Postboks 1080 Blindern
0316 Oslo
Publikasjoner
-
Pavlović, Milena; al Hajj, Ghadi; Kanduri, Chakravarthi; Pensar, Johan; Wood, Mollie Elizabeth & Sollid, Ludvig Magne [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2024). Improving generalization of machine learning-identified biomarkers using causal modelling with examples from immune receptor diagnostics. Nature Machine Intelligence. 6(1), s. 15–24. doi: 10.1038/s42256-023-00781-8.
-
Shakibfar, Saeed; Zhao, Jing; Li, Huiqi; Nordeng, Hedvig Marie Egeland; Lupattelli, Angela & Pavlović, Milena [Vis alle 12 forfattere av denne artikkelen] (2023). Machine learning-driven development of a disease risk score for COVID-19 hospitalization and mortality: a Swedish and Norwegian register-based study. Frontiers in Public Health. ISSN 2296-2565. 11. doi: 10.3389/fpubh.2023.1258840. Fulltekst i vitenarkiv
-
Kanduri, Chakravarthi; Scheffer, Lonneke; Pavlović, Milena; Rand, Knut Dagestad; Chernigovskaia, Maria & Pirvandy, Oz [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2023). simAIRR: simulation of adaptive immune repertoires with realistic receptor sequence sharing for benchmarking of immune state prediction methods. GigaScience. ISSN 2047-217X. 12, s. 1–16. doi: 10.1093/gigascience/giad074. Fulltekst i vitenarkiv
-
Shakibfar, Saeed; Nyberg, Fredrik; Li, Huiqi; Zhao, Jing; Nordeng, Hedvig Marie Egeland & Sandve, Geir Kjetil Ferkingstad [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2023). Artificial intelligence-driven prediction of COVID-19-related hospitalization and death: a systematic review. Frontiers in Public Health. ISSN 2296-2565. 11. doi: 10.3389/fpubh.2023.1183725. Fulltekst i vitenarkiv
-
Robert, Philippe Paul Auguste; Akbar, Rahmad; Frank, Robert; Pavlović, Milena; Widrich, Michael & Snapkov, Igor [Vis alle 25 forfattere av denne artikkelen] (2022). Unconstrained generation of synthetic antibody–antigen structures to guide machine learning methodology for antibody specificity prediction. Nature Computational Science. ISSN 2662-8457. 2(12), s. 845–865. doi: 10.1038/s43588-022-00372-4.
-
Kanduri, Chakravarthi; Pavlović, Milena; Scheffer, Lonneke; Motwani, Keshav; Chernigovskaia, Maria & Greiff, Victor [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2022). Profiling the baseline performance and limits of machine learning models for adaptive immune receptor repertoire classification. GigaScience. ISSN 2047-217X. 11(05). doi: 10.1093/gigascience/giac046. Fulltekst i vitenarkiv
-
Akbar, Rahmad; Robert, Philippe Paul Auguste; Weber, Cédric R.; Widrich, Michael; Frank, Robert & Pavlovic, Milena [Vis alle 19 forfattere av denne artikkelen] (2022). In silico proof of principle of machine learning-based antibody design at unconstrained scale. mAbs. ISSN 1942-0862. 14:e2031482(1), s. 1–18. doi: 10.1080/19420862.2022.2031482. Fulltekst i vitenarkiv
-
Slabodkin, Andrei; Chernigovskaia, Maria; Mikocziova, Ivana; Akbar, Rahmad; Scheffer, Lonneke & Pavlović, Milena [Vis alle 16 forfattere av denne artikkelen] (2021). Individualized VDJ recombination predisposes the available Ig sequence space. Genome Research. ISSN 1088-9051. 31(12), s. 2209–2225. doi: 10.1101/gr.275373.121. Fulltekst i vitenarkiv
-
Pavlović, Milena; Scheffer, Lonneke; Motwani, Keshav; Kanduri, Chakravarthi; Kompova, Radmila & Vazov, Nikolay Aleksandrov [Vis alle 41 forfattere av denne artikkelen] (2021). The immuneML ecosystem for machine learning analysis of adaptive immune receptor repertoires. Nature Machine Intelligence. 3(11), s. 936–944. doi: 10.1038/s42256-021-00413-z.
-
Arnaout, Ramy A.; Luning Prak, Eline T.; Schwab, Nicholas; Rubelt, Florian; Greiff, Victor & Pavlović, Milena [Vis alle 32 forfattere av denne artikkelen] (2021). The Future of Blood Testing Is the Immunome. Frontiers in Immunology. ISSN 1664-3224. 12:626793, s. 1–6. doi: 10.3389/fimmu.2021.626793. Fulltekst i vitenarkiv
-
Akbar, Rahmad; Robert, Philippe Paul Auguste; Pavlović, Milena; Jeliazkov, Jeliazko R.; Snapkov, Igor & Slabodkin, Andrei [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2021). A compact vocabulary of paratope-epitope interactions enables predictability of antibody-antigen binding. Cell reports. ISSN 2211-1247. 34:108856(11), s. 1–21. doi: 10.1016/j.celrep.2021.108856. Fulltekst i vitenarkiv
-
Yao, Ying; Zia, Asima; Neumann, Ralf Stefan; Pavlović, Milena; Balaban, Gabriel & Lundin, Knut Erik Aslaksen [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2021). T cell receptor repertoire as a potential diagnostic marker for celiac disease. Clinical Immunology. ISSN 1521-6616. 222:108621, s. 1–7. doi: 10.1016/j.clim.2020.108621. Fulltekst i vitenarkiv
-
Weber, Cédric R.; Akbar, Rahmad; Yermanos, Alexander; Pavlovic, Milena; Snapkov, Igor & Sandve, Geir Kjetil [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2020). immuneSIM: tunable multi-feature simulation of B- and T-cell receptor repertoires for immunoinformatics benchmarking. Bioinformatics. ISSN 1367-4803. 36(11), s. 3594–3596. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa158. Fulltekst i vitenarkiv
-
Brown, Alex; Snapkov, Igor; Akbar, Rahmad; Pavlovic, Milena; Miho, Enkelejda & Sandve, Geir Kjetil [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2019). Augmenting adaptive immunity: progress and challenges in the quantitative engineering and analysis of adaptive immune receptor repertoires. Molecular Systems Design & Engineering. ISSN 2058-9689. 4(4), s. 701–736. doi: 10.1039/c9me00071b.
-
Torgersen, Eivind; Geir Kjetil, Sandve; Greiff, Victor; Pavlovic, Milena & Scheffer, Lonneke (2022). Fra bare én blodprøve kan kunstig intelligens gi diagnose for mange ulike sykdommer. Titan.uio.no.
-
Widrich, Michael; Schäfl, Bernhard; Pavlović, Milena; Ramsauer, Hubert; Gruber, Lukas & Holzleitner, Markus [Vis alle 11 forfattere av denne artikkelen] (2020). Modern Hopfield Networks and Attention for Immune Repertoire Classification. Vis sammendrag
Publisert
8. apr. 2019 09:55
- Sist endret
8. apr. 2019 09:56