Jeg er senioringeniør på IFI, finansiert via ELIXIR.NO prosjektet, som er den norske noden av det europeiske ELIXIR prosjektet. Jeg har tidligere fullført min PhD grad, med Professor Eivind Hovig og Førsteamanuensis Geir Kjetil Sandve som veiledere. Se den engelske siden for mer info.
Sveinung Gundersen
Senioringeniør
-
Senter for bioinformatikk
English version of this page
E-post
sveinugu@ifi.uio.no
Telefon
+47 22840862
Brukernavn
Besøksadresse
Gaustadalleen 23 B
Ole Johan Dahls hus
0373 Oslo
Postadresse
Postboks 1080, Blindern
0316 Oslo
Publikasjoner
-
D’Anna, Flora; Waheed, Zahra; Mohamed, Anliat; Gupta, Dipaya; Keyvani, Pedram A & El-Gebali, Sara [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2023). Streamlining data brokering from Research Data Management platforms to ELIXIR Repositories. OSF Preprints. doi: 10.37044/osf.io/mwk9f.
-
Rauluseviciute, Ieva; Riudavets-Puig, Rafael; Blanc-Mathieu, Romain; Castro Mondragon, Jaime Abraham; Ferenc, Katalin Terezia & Kumar, Vipin [Vis alle 20 forfattere av denne artikkelen] (2023). JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 52(D1), s. D174–D182. doi: 10.1093/nar/gkad1059. Vis sammendrag
-
Nakken, Sigve; Gundersen, Sveinung; Bernal, Fabian Leonardo Martinez; Polychronopoulos, Dimitris; Hovig, Eivind & Wesche, Jørgen (2023). Comprehensive interrogation of gene lists from genome-scale cancer screens with oncoEnrichR. International Journal of Cancer. ISSN 0020-7136. 153(10), s. 1819–1828. doi: 10.1002/ijc.34666. Fulltekst i vitenarkiv
-
Kalyanasundaram, Sumana; Lefol, Yohan Pierre; Gundersen, Sveinung; Rognes, Torbjørn; Alsøe, Lene & Nilsen, Hilde [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2023). hGSuite HyperBrowser: A web-based toolkit for hierarchical metadata-informed analysis of genomic tracks. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 18(7). doi: 10.1371/journal.pone.0286330. Fulltekst i vitenarkiv
-
Gundersen, Sveinung; Boddu, Sanjay; Capella-Gutierrez, Salvador; Drabløs, Finn; Fernández, José M. & Kompova, Radmila [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2021). Recommendations for the FAIRification of genomic track metadata. F1000 Research. ISSN 2046-1402. 10. doi: 10.12688/f1000research.28449.1. Fulltekst i vitenarkiv
-
Pavlović, Milena; Scheffer, Lonneke; Motwani, Keshav; Kanduri, Chakravarthi; Kompova, Radmila & Vazov, Nikolay Aleksandrov [Vis alle 41 forfattere av denne artikkelen] (2021). The immuneML ecosystem for machine learning analysis of adaptive immune receptor repertoires. Nature Machine Intelligence. 3(11), s. 936–944. doi: 10.1038/s42256-021-00413-z.
-
Kanduri, Srinivasa Kalyana Chakravarthi; Bock, Christoph; Gundersen, Sveinung; Hovig, Eivind & Sandve, Geir Kjetil (2019). Colocalization analyses of genomic elements: approaches, recommendations and challenges. Bioinformatics. ISSN 1367-4803. 35(9), s. 1615–1624. doi: 10.1093/bioinformatics/bty835. Fulltekst i vitenarkiv
-
Simovski, Boris; Kanduri, Srinivasa Kalyana Chakravarthi; Gundersen, Sveinung; Titov, Dmytro; Domanska, Diana Ewa & Bock, Christoph [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2018). Coloc-stats: A unified web interface to perform colocalization analysis of genomic features. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 46(1), s. W186–W193. doi: 10.1093/nar/gky474. Fulltekst i vitenarkiv
-
Tekle, Kidane M; Gundersen, Sveinung; Klepper, Kjetil; Bongo, Lars Ailo; Raknes, Inge Alexander & Li, Xiaxi [Vis alle 22 forfattere av denne artikkelen] (2018). Norwegian e-Infrastructure for Life Sciences (NeLS). F1000 Research. ISSN 2046-1402. 7:968. doi: 10.5256/f1000research.16472.r35600. Fulltekst i vitenarkiv
-
Simovski, Boris; Vodak, Daniel; Gundersen, Sveinung; Domanska, Diana Ewa; Azab, Abdulrahman & Holden, Lars [Vis alle 25 forfattere av denne artikkelen] (2017). GSuite HyperBrowser: integrative analysis of dataset collections across the genome and epigenome. GigaScience. ISSN 2047-217X. 6(7), s. 1–12. doi: 10.1093/gigascience/gix032. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag
-
Bengtsen, Mads; Klepper, Kjetil; Gundersen, Sveinung; Cuervo Torre, Ignacio; Drabløs, Finn & Hovig, Johannes Eivind [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2015). c-Myb Binding Sites in Haematopoietic Chromatin Landscapes. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 10(7). doi: 10.1371/journal.pone.0133280. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag
-
Paulsen, Jonas; Sandve, Geir Kjetil F.; Gundersen, Sveinung; Lien, Tonje Gulbrandsen; Trengereid, Kai & Hovig, Johannes Eivind (2014). HiBrowse: Multi-purpose statistical analysis of genome-wide chromatin 3D organization. Bioinformatics. ISSN 1367-4803. 30(11), s. 1620–1622. doi: 10.1093/bioinformatics/btu082. Fulltekst i vitenarkiv
-
Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Johansen, Morten; Glad, Ingrid Kristine; Gunathasan, Krishanthi & Holden, Lars [Vis alle 21 forfattere av denne artikkelen] (2013). The Genomic HyperBrowser: an analysis web server for genome-scale data. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 41(W1), s. W133–W141. doi: 10.1093/nar/gkt342. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag
-
Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Rydbeck, Halfdan; Glad, Ingrid Kristine; Holden, Lars & Holden, Marit [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2011). The differential disease regulome. BMC Genomics. ISSN 1471-2164. 12. doi: 10.1186/1471-2164-12-353. Vis sammendrag
-
Gundersen, Sveinung; Kalaš, Matúš; Abul, Osman; Frigessi, Arnoldo; Hovig, Eivind & Sandve, Geir Kjetil (2011). Identifying elemental genomic track types and representing them uniformly. BMC Bioinformatics. ISSN 1471-2105. 12. doi: 10.1186/1471-2105-12-494.
-
Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Rydbeck, Halfdan; Glad, Ingrid Kristine; Holden, Lars & Holden, Marit [Vis alle 14 forfattere av denne artikkelen] (2010). The Genomic HyperBrowser: inferential genomics at the sequence level. Genome Biology. ISSN 1465-6906. 11(12). doi: 10.1186/gb-2010-11-12-r121. Fulltekst i vitenarkiv Vis sammendrag
-
Evensen, Jonas; Gundersen, Sveinung; Kristoffersen, Anja Bråthen & Lagesen, Karin (2016). STRAINTRACER-DB: A flexible analysis and persistent storage system for sequence and epidemiological data.
-
Simovski, Boris; Drabløs, Finn Sverre; Gundersen, Sveinung; Johansen, Morten; Domanska, Diana Ewa & Azab, Abdulrahman [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2016). The Genomic HyperBrowser.
-
Gundersen, Sveinung; Bianchini, Federico; Vázquez, Pável; Cheneby, Jeanne Marie; Kalaš, Matúš & Baskaran, Joshua [Vis alle 7 forfattere av denne artikkelen] (2024). D3.4 (M18) - Report on developments and operations of the FAIRtracks ecosystem (an ELIXIR Norway ELIXIR3 deliverable). Zenodo.
-
Vazquez, Pavel; Gundersen, Sveinung; Visnovska, Martina & Bianchini, Federico (2024). D5.5 (M12)- Report of "Framework for achieving import of sensitive data obtained from external sources and deployed infrastructure for ELIXIR BioContainers repository in secure compute environments". Zenodo.
-
Calhoun, Erin Elizabeth; Kalaš, Matúš; Bösl, Korbinian Michael; Fatima, Nazeefa; Gundersen, Sveinung & Klemetsen, Terje [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2023). D3.3 (M18) - Report on curation in core ELIXIR registries (an ELIXIR Norway ELIXIR3 deliverable). Zenodo. Fulltekst i vitenarkiv
Publisert
4. des. 2013 11:43
- Sist endret
14. des. 2022 12:58