Sveinung Gundersen

Senioringeniør - Senter for bioinformatikk
Bilde av Sveinung Gundersen
English version of this page
Telefon +47 22840862
Brukernavn
Besøksadresse Gaustadalleen 23 B Ole Johan Dahls hus 0373 Oslo
Postadresse Postboks 1080, Blindern 0316 Oslo

Jeg er senioringeniør på IFI, finansiert via ELIXIR.NO prosjektet, som er den norske noden av det europeiske ELIXIR prosjektet. Jeg har tidligere fullført min PhD grad, med Professor Eivind Hovig og Førsteamanuensis Geir Kjetil Sandve som veiledere. Se den engelske siden for mer info.

Emneord: Bioinformatikk, Genomikk, Statistikk, Informatikk, ELIXIR Oslo

Publikasjoner

  • D’Anna, Flora; Waheed, Zahra; Mohamed, Anliat; Gupta, Dipaya; Keyvani, Pedram A & El-Gebali, Sara [Vis alle 8 forfattere av denne artikkelen] (2023). Streamlining data brokering from Research Data Management platforms to ELIXIR Repositories. OSF Preprints. doi: 10.37044/osf.io/mwk9f.
  • Rauluseviciute, Ieva; Riudavets-Puig, Rafael; Blanc-Mathieu, Romain; Castro Mondragon, Jaime Abraham; Ferenc, Katalin Terezia & Kumar, Vipin [Vis alle 20 forfattere av denne artikkelen] (2023). JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 52(D1), s. D174–D182. doi: 10.1093/nar/gkad1059.
  • Nakken, Sigve; Gundersen, Sveinung; Bernal, Fabian Leonardo Martinez; Polychronopoulos, Dimitris; Hovig, Eivind & Wesche, Jørgen (2023). Comprehensive interrogation of gene lists from genome-scale cancer screens with oncoEnrichR. International Journal of Cancer. ISSN 0020-7136. 153(10), s. 1819–1828. doi: 10.1002/ijc.34666. Fulltekst i vitenarkiv
  • Kalyanasundaram, Sumana; Lefol, Yohan Pierre; Gundersen, Sveinung; Rognes, Torbjørn; Alsøe, Lene & Nilsen, Hilde [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2023). hGSuite HyperBrowser: A web-based toolkit for hierarchical metadata-informed analysis of genomic tracks. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 18(7). doi: 10.1371/journal.pone.0286330. Fulltekst i vitenarkiv
  • Gundersen, Sveinung; Boddu, Sanjay; Capella-Gutierrez, Salvador; Drabløs, Finn; Fernández, José M. & Kompova, Radmila [Vis alle 10 forfattere av denne artikkelen] (2021). Recommendations for the FAIRification of genomic track metadata. F1000 Research. ISSN 2046-1402. 10. doi: 10.12688/f1000research.28449.1. Fulltekst i vitenarkiv
  • Pavlović, Milena; Scheffer, Lonneke; Motwani, Keshav; Kanduri, Chakravarthi; Kompova, Radmila & Vazov, Nikolay Aleksandrov [Vis alle 41 forfattere av denne artikkelen] (2021). The immuneML ecosystem for machine learning analysis of adaptive immune receptor repertoires. Nature Machine Intelligence. 3(11), s. 936–944. doi: 10.1038/s42256-021-00413-z.
  • Kanduri, Srinivasa Kalyana Chakravarthi; Bock, Christoph; Gundersen, Sveinung; Hovig, Eivind & Sandve, Geir Kjetil (2019). Colocalization analyses of genomic elements: approaches, recommendations and challenges. Bioinformatics. ISSN 1367-4803. 35(9), s. 1615–1624. doi: 10.1093/bioinformatics/bty835. Fulltekst i vitenarkiv
  • Simovski, Boris; Kanduri, Srinivasa Kalyana Chakravarthi; Gundersen, Sveinung; Titov, Dmytro; Domanska, Diana Ewa & Bock, Christoph [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2018). Coloc-stats: A unified web interface to perform colocalization analysis of genomic features. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 46(1), s. W186–W193. doi: 10.1093/nar/gky474. Fulltekst i vitenarkiv
  • Tekle, Kidane M; Gundersen, Sveinung; Klepper, Kjetil; Bongo, Lars Ailo; Raknes, Inge Alexander & Li, Xiaxi [Vis alle 22 forfattere av denne artikkelen] (2018). Norwegian e-Infrastructure for Life Sciences (NeLS). F1000 Research. ISSN 2046-1402. 7:968. doi: 10.5256/f1000research.16472.r35600. Fulltekst i vitenarkiv
  • Simovski, Boris; Vodak, Daniel; Gundersen, Sveinung; Domanska, Diana Ewa; Azab, Abdulrahman & Holden, Lars [Vis alle 25 forfattere av denne artikkelen] (2017). GSuite HyperBrowser: integrative analysis of dataset collections across the genome and epigenome. GigaScience. ISSN 2047-217X. 6(7), s. 1–12. doi: 10.1093/gigascience/gix032. Fulltekst i vitenarkiv
  • Bengtsen, Mads; Klepper, Kjetil; Gundersen, Sveinung; Cuervo Torre, Ignacio; Drabløs, Finn & Hovig, Johannes Eivind [Vis alle 9 forfattere av denne artikkelen] (2015). c-Myb Binding Sites in Haematopoietic Chromatin Landscapes. PLOS ONE. ISSN 1932-6203. 10(7). doi: 10.1371/journal.pone.0133280. Fulltekst i vitenarkiv
  • Paulsen, Jonas; Sandve, Geir Kjetil F.; Gundersen, Sveinung; Lien, Tonje Gulbrandsen; Trengereid, Kai & Hovig, Johannes Eivind (2014). HiBrowse: Multi-purpose statistical analysis of genome-wide chromatin 3D organization. Bioinformatics. ISSN 1367-4803. 30(11), s. 1620–1622. doi: 10.1093/bioinformatics/btu082. Fulltekst i vitenarkiv
  • Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Johansen, Morten; Glad, Ingrid Kristine; Gunathasan, Krishanthi & Holden, Lars [Vis alle 21 forfattere av denne artikkelen] (2013). The Genomic HyperBrowser: an analysis web server for genome-scale data. Nucleic Acids Research (NAR). ISSN 0305-1048. 41(W1), s. W133–W141. doi: 10.1093/nar/gkt342. Fulltekst i vitenarkiv
  • Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Rydbeck, Halfdan; Glad, Ingrid Kristine; Holden, Lars & Holden, Marit [Vis alle 15 forfattere av denne artikkelen] (2011). The differential disease regulome. BMC Genomics. ISSN 1471-2164. 12. doi: 10.1186/1471-2164-12-353.
  • Gundersen, Sveinung; Kalaš, Matúš; Abul, Osman; Frigessi, Arnoldo; Hovig, Eivind & Sandve, Geir Kjetil (2011). Identifying elemental genomic track types and representing them uniformly. BMC Bioinformatics. ISSN 1471-2105. 12. doi: 10.1186/1471-2105-12-494.
  • Sandve, Geir Kjetil; Gundersen, Sveinung; Rydbeck, Halfdan; Glad, Ingrid Kristine; Holden, Lars & Holden, Marit [Vis alle 14 forfattere av denne artikkelen] (2010). The Genomic HyperBrowser: inferential genomics at the sequence level. Genome Biology. ISSN 1465-6906. 11(12). doi: 10.1186/gb-2010-11-12-r121. Fulltekst i vitenarkiv

Se alle arbeider i Cristin

Se alle arbeider i Cristin

Publisert 4. des. 2013 11:43 - Sist endret 14. des. 2022 12:58