Satelitt DNA

Satelitt DNA - Repeterte DNA-sekvenser som har forskjellig tetthet enn resten av kjerne DNA ved sentrifugering. De finnes vanligvis som et DNA-bånd med mindre tetthet enn resten av genomisk DNA. Satelitt DNA viser stor variasjon mellom arter og antallet tandemrepeterte basesekvenser varierer fra få til mange hundre.

Siden satellitt-DNA har forskjellig tetthet enn resten kan det bli isolert ved differensiell ultrasentrifugering hvor forskjellige deler av oppkuttet DNA fordeler seg på forskjellige steder i sentrifugerøret avhengig av tettheten. En enhet bestående av 100 – 10000 basepar kan være repetert fra 1-10 ganger.

Satellitt-DNA er det i tre hovedtyper: 1) Ordinære satelitter fra fra 100000 til 10 millioner basepar. 2) Minisatligger 100 til 10000 basepar. 3) Mikrosatelitter med 10 til 100 basepar.

Mye satelitt-DNA er lokalisert til telomere og centromere. Centromerene i kromosomet er nødvendig for å kunne atskille kromatidene ved celledeling.

Spredte ispedd repetert DNA utover i genomet  kan utgjøre fra 25-40% av pattedyrgenomet. Hos primatene inneholder ca. 5% av genomet Alu-elementer  med enheter på ca. 300 basepar. Alu-elementer har fått navn etter retstriksjonsenzymet Alu fra Arthrobacter luteus og fungerer som transposerbare elementer (retrotransposoner) som påvirker evolusjon av genomet. Mange Alu-elementer blir transkribert til RNA, det vil si at repetert DNA også kan være kodende.

Ved den arvelige sykdommen fragilt-X-syndrom er det abnorme lengder med satellitt-DNA hvor CGG i X-kromosomet blir repetert ca. 100 til 1000 ganger i 5’-ikketranslaterbar region til genet fragilt-X.mentalretardasjon (FMR1) , mens normalt er ca. 30 ganger. Store mengder repetert CGG kan gi hårnålsløkker og slukking av genet FMR1.   

Ved Huntingtons sykdom blir en triplett CAG repetert feil og får større lengde enn normalt, men forskjellig fra fragilt-X-syndrom blir det oversatt til protein med glutamin, og antall glutamin påvirker graden av sykdom.

Tilbake til hovedside

Publisert 4. feb. 2011 10:48 - Sist endret 11. mai 2022 14:46