Eksempler på ledefossiler (indeksfossiler, indikatorfossiler, sonefossiler) anvendt innen biostratigrafi er graptolitter, ammonitter, blekksprutskall, brachiopoder, echinodermer, mineralisering av bein og tenner fra vertebrater, avtrykk av eksoskjelett til invertegrater, koprolitter, karbonavtrykk (karbonfilm, fytoleim) fra plantedeler, samt mikrofossiler som foraminiferer og coccolitoforider. For dateringer av nyere tid kan man anvende årringanalyse (dendrokronologi). Fossiler og fossile avtrykk kan gi en biosignatur fra en spesiell tidsperiode, og som utfyller kunnskap om tidsperioder fra radiologisk datering.
Superposisjonsprinsippet i stratigrafisk datering, de eldste lagene vil være i bunnen, formulert av danske Nicholas Steno. Et materiale kan ikke være eldre enn det materialet det er laget fra.