Domene

Domene (gr. domos - hus, struktur) - Område på et protein med bestemt tertiærstruktur (f.eks. globulær (kuleformet) eller stavlignende (fingerformet) proteindomene) og som har en karakteristisk struktur- og bindingsaktivitet med spesifikk molekylær funksjon  DNA-bindende domene i  DNA som kan binde transkripsjonsfaktorer. Domener i RNA.  Domene i et reseptormolekyl som binder en ligand

Brukt i systematikk om de 3 domener (l. dominium) foreslått av Carl Woese, Otto Kandler, og Mark Wheelis i 1990: Ekte bakterier (Bacteria), arkebakterier (Archaea)  og eukaryoter (Eukarya).

Et reseptorbindende domene er lokalisert på overflateproteinet som danner pigger (spikerprotein) på et virus, og binder seg spesifikt til en reseptor på overflaten til en celle. For eksempel pigg glykoprotein S  på overflaten til coronaviruset sars-cov-2 binder seg til ACE2-reseptor på vertscellene. Mutasjoner som gir endringer i reseptorbindende domene på S-proteinet som bytter ut en aminosyre med en annen, for eksempel S486P, aminosyren serin(S) byttet til prolin (P) gir en omikron XBB-variant.

Korte aminosyresekvenser i et protein kan dannet et funksjonelt motiv og bindingssete til andre proteiner og danner basis for virkemåten . For eksempel proteaser som gjenkjenner sekvenser i målproteinet som de deretter kløyver i to deler. 

Aptamere i RNA er uavhengige domener som kan binde forskjellige ligander (guanidin, fosforibosylpyrofosfat, guanosin tetrafosfat ((ppGpp). Aptamere er korte enkelttrådete RNA, også DNA, som binder seg spesifikt til proteiner, peptider og karbohydrater

Domene et område i et magnet og som har spesielle egenskaper i en tilsynelatende homogen krystallstruktur, i form av helikser eller spiraler.

Domene på internett.

Tilbake til hovedside

Publisert 4. feb. 2011 10:15 - Sist endret 9. jan. 2023 10:14