Orfane gener

Orfane gener (gr. orphanós - uten en forelder, farløs) er gener som er  taksonomisk avgrenset til en art og hvor det ikke finnes noen gjenkjennbare og homologe gener i andre nærstående taksonomiske linjer.  Orfane gener lager proteiner som har aminosyresekvens ikke kjent fra andre proteiner. Orfane gener, også kalt ORFaner («opeen reading frames») og fungerer som åpne leserammer i kromosomer. De har både startkodon og stoppkodon og koder for proteiner med ukjent funksjon, og man finner ingen tilsvarende kjente gensekvenser hos andre arter.  Det viser seg at orfane gener har en raskere evolusjon enn andre gener, men opprinnelsen til orfane gener er fremdeles ubesvart. Det samme gjelder funksjonen til orfane gener, men de koder for korte proteiner. En hypotese er at orfane gener utvikler seg så raskt at de mister likhet med andre gener. For de fleste gener finner man homologe gener hos andre arter og, men ikke for orfane gener.

Orfane gener kan under evolusjonen ha oppstått ved rekombinasjon av andre gener,  gendupliseirng og omstokking av åpne leserammer.   Studiet av orfane gener startet med studier av gener hos gjær gener i regionen for alkohol dehydrogenase, et gen for  en zinkfinger transkripsjonsfaktor og et chaperon gen.  Ved å sammenligne cDNA-bibliotek fra de to arter bananfluer Drosophila aakuba og Drosophila melanogaster har man identifisert flere proteinkodende orfane gener.

Ved sekvensering av bakteriene Hemophilus influenzae og  Mycoplasma genitalium der det også funnetorfane gener.

Litteratur

Wikipedia

Tilbake til hovedside

Publisert 27. des. 2024 14:35 - Sist endret 27. des. 2024 14:35