I noen tilfeller kjenner man ikke til nytten bakteriene har av plasmider, men de kan også inneholde gener som er nytte for bakterien, for eksempel resistensgener som gir beskyttelse mot antibiotika. Plasmider som inneholder et gen som koder for β-laktamase deltar i inaktivering av β-laktam-antibiotika (penicillin, amoksicillin, ampicilin). Plasmider kan bli overført mellom bakterier innen samme art, men også til andre arter og sprer derfor raskt antibiotikaresistens.
Plasmider kan bli brukt som kloningsvektorer innen molekylærbiologi.
Tumorinduserende plasmid hos Agrobacterium
Ti-plasmidet hos bakterien Agrobacterium spiller en viktig rolle under infeksjonsprosessen i planter hvor det dannes krongalle.
