Kompleks I (NADH dehydrogenase) gir oksidasjon av NADH som kommer fra matrikssiden og reduksjon av ubikinon (koenzym Q). Oksidert ubikinon kan motta to elektroner og to protoner og blir redusert til ubikinol (hydrokinon). Komplekset inneholder FMN og jern-svovelsentre og kan hemmes av rotenon.
Kompleks II består av membranbundet succinat dehydrogenase som inneholder FAD og jern-svovelproteiner og reduserer ubikinon.
Kompleks III (cytokrom bc1 kompleks) frakter elektroner fra ubikinol til cytokrom c. Komplekset inneholder cytokrom c1, cytokrom b og jern-svovelproteiner (Rieske-protein) og kan hemmes av antimycin A.
Kompleks IV (cytokrom oksidase) overfører elektroner fra cytokrom c til oksygen. Komplekset inneholder cytokrom a, cytokrom a3 og kobberatomer og kan hemmes av cyanid, azid og karbonmonoksid. Respirasjonskjeden hos planter skiller seg fra andre på følgende punkter ved å ha:
1) En ekstern ytre dehydrogenase som kan oksidere NADH fra cytosol i intermembranrommet. Dette gir en rotenon- ufølsom oksidasjon av NADH forskjellig fra kompleks I.
2) Cyanid- og antimycin A-ufølsom (- resistent) alternativ elektrontransport hvor elektroner fraktes fra ubikinol til oksygen utenom cytokrom oksidase.
3) En NADPH dehydrogenase som kan oksidere NADPH på matrikssiden.