Endotoksiner kommer fra Gram-negative bakterier som har en cellevegg med lipopolysakkarider. Når bakterien dør frigjøres lipopolysakkarid og virker som et endotoksin, slik som hos Salmonella. Salmonella typhii gir tyfoidfeber. Salmonella i kylling, grønnsaker. Tarmbakterien Escherichia coli stamme K-12 er helt harmløs, men E.coli stamme O157:H7 , ”hambugerbakterien” gir alvorlig tarminfeksjon og nyreskader. Sannsynligvis har stamme O157:H7 mottatt gener fra en bakteriofag via horisontal genoverføring (transduksjon) hvorav noen lager proteiner som gjør at O157:H12 fester seg til tarmveggen og henter næring.
Se eksotoksiner og enterotoksiner