Tre undertyper Ffåttbåren encefalittvirus. Den europeiske (TBEV-Eu), Sibiske (TBEV-Sib) og den fjerne østen med Kina og Japan (TBEV-FE).
En østlig genotype smitter via taigaflått (Ixodes persulcatus) med seksuell kjønnsdimorfi
TBEV-genom
RAN-genomet har størrelse ca. 10 kilobaser (kb) = 10000 baser, med én leseramme som koder for et polyprotein. Proproteinetm blir kløyvd etter translasjon og posttranslasjonsregulert av proteaser både fra viruset og mennesket. Kløyvingen av polyproteinet lager strukturproteiene kapsidproteinet C, premembranproteinet PrM, og membrankappeprotein E samt ikke-strukturporteiene NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, og NS5.
Litteratur
Zakotnik S, Knap N, Bogovič P, Zorec TM, Poljak M, Strle F, Avšič-Županc T, Korva M. Complete Genome Sequencing of Tick-Borne Encephalitis Virus Directly from Clinical Samples: Comparison of Shotgun Metagenomic and Targeted Amplicon-Based Sequencing. Viruses. 2022 Jun 10;14(6):1267. doi: 10.3390/v14061267.
Wikipedia