RNA-virus

RNA-virus  i superrike Riboviria,  rike Orthornavirae omfatter virus har et genom som koder for enzymet RNA-avhengig RNA polymerase (RNA-replikase) som oversetter virus-RNA til nytt RNA.  RNA-replikase gjør lett feil i replikasjonen noe som raskt bidrar til mutasjoner og nye genvarianter. Man antar at RNA-virus er monofyletiske. RNA-virus har genmateriale i form av enkelttrådet eller dobbelttrådet RNA og har høy mutasjonsrate. RS-virus, influensavirus, SARS, vanlig forkjølelsesvirus, hepatitis C virus er eksempler på RNA-virus. RNA-virus er omgitt av et kapsid form av en proteinkappe som beskytter nukleinsyrene. Virus gjennomgår evolusjon og RNA-virus hHar mange genmutasjoner, omstokking og rekombinasjoner som gir virusvarianter. Immunsystemet hos prokaryter og eukaryter gir et seleksjonspress og bidrar til virusseleksjon og virusevolusjon. RNA-replikase har slektskap med ribozymer (gruppe II introner), revers transkriptase og retrotransposoner, muligens med opprinnelse fra en tidligere RNA-verden.

Enkelttrådet positiv sens RNA-virus

Enkelttrådet positiv sens RNA-virus (+ssRNA), hvor genomet kan virke direkte som mRNA som på vertscellenes ribosomer blir direkte oversatt til  virusproteiner som blir koblet sammen til nye viruspartikler. Er ikke avhengig av transkripsjon av virusgenomet, det kan brukes direkte. Hører med til gruppe IV i Baltimore klassifikasjonssystemet. To forskjellige virusgenomer i samme celle kan gjennomgå genetisk rekombinasjon. Omfatter Dengue-virus, SARS-Cov1-virus, SARS-Cov2 virus, West Nile virus, , rhinovirus, poliovirus, hepatitt C-virus.

 Omfatter rekkene Kitrinoviricota, Lenarviricota og Pisuviricota.

Rekke Kitrinoviricota

Klasse Asuviricetes med alfavirus som infekterer planter og artropoder

Klasse Flasuviricetes med flavivirus (Flaviviridae). Denguevirus

Klasse Magsaviricetes med rodavirus,

Klasse Tolucaviricetes med virus som infekterer planter.

Rekke Lenarviricota

Klasse Amabiliviricetes  med narnavirus som infekterer sopp.

Klasse Howeltoviricetes med mitovirus

Klasse Leviviricetes med levivirus.

Klasse Miaviricetes med  botourmiavirus.

Rekke Pisuviricota

Rekke som omfatter supergruppen picornavirus (Picornaviridae) som infekterer eukaryoter: dyr, planter, sopp og protister.

Klasse Duplopiviricetes som inneholder dobbelttrådet RNA-virus avledet fra ss(+)RNA-virus

Klasse Pisoniviricetes  med picornavirus (Picornaviridae), nidovirus (Nidoviridae), sobelivirus, coronavirus (Coronaviridae). Coxsackie B-virus er et sykdomsfremkallende enterovirus finnes i forskjellige serotyper CBV1-CBV6.

Klasse Stelpaviricetes med astrovirus (Astroviridae) og potyvirus (Potyviridae).

Enkelttrådet negativ sens RNA-virus

Enkelttrådet negativ sens RNA-virus (ss(-)RNA-virus) har et genom som er komplementært til mRNA. Gruppe V i Baltimore klassifikasjonssystemet. RNA-avhengig RNA polymerase lager mRNA med virusgenom som templat (oppskrift). Ved virusreplikasjon lager RNA-replikase et positiv sens antigenom som deretter kan bli brukt å lage negativ sens RNA genom. Har vanligvis en membrankappe som omgir kapsidet. Man antar at ss(-)RNA-virus er etterkommere etter dsRNA-virus.

Humant metapneumovirus (HMPV) er et enkelttrådet negativ sens RNA-virus i familien Paramyxovididae somer en meget vanlig forekommende og gir luftveisinfeksjon. Spres ved sekret- og dråpesmitte.

Rekke Nagarnaviricota

(l. nega- negativ, rna- RNA, -viricota –betegnelse på virusrekke)

Delt i underrekkene Haploviricotina (gr. haplo – enkel) og Polyploviricotina.(gr. polyplo- kompleks)  

Eksempler på ss(-)RNA-virus er

Arenaviridae (Lassavirus, lymfocytisk koriomeningittvirus)

Filoviridae (ebolavirus, marburgvirus)

Hantaviridae (Hantavirus)

Paramyxoviridae (kusmavirus, meslingvirus, humant respiratorisk syncytialvirus (RS-virus), Humant metapneumovirus,parafinfluensavirus).

Rinderpest (ty. rinder  – storfe), storfepest  er ven virussykdom forårsaket av negativ sens enkelttrådet RNA virus, Morbillivirus, familie Paramyxoviridae, samme gruppe som meslingvirus. Viruset gir sykdom hos partåete hovdyr/klauvdyr ( Artiodactyla) Rinderpstvirus spredde seg fra Nord-Afrika fra 1889 yil Kapplandet 1897 og forårsaket massedød av afrikabøffel/kafferbøffel (Cyncerus caffer) og stripegnu (Connochaetes taurinus), mens steppesebra (Equus burchelli) tålte viruset.

Rhabdoviridae (rabiesvirus, veskulær stomatittvirus)

 Orthomyxoviridae (influensavirus)

Dobbelttrådet RNA-virus

Dobbelttrådet RNA-virus (dsRNA-virus) bruker den negative genomtråden som templat for å lage mRNA katalysert av RNA-avhengig RNA-polymerase. Den andre tråden brukes for å lage dobbelttrådet RNA. Celler har utviklet et immunsystem med mekanismer som fjerner dobbelttrådet RNA. Viruset har derfor pakket genomet i et kapsid for å beskytte genomet sitt mot agrep fra immunsystemet i vertscellene. Gruppe III i Baltimore klassifikasjonssystemet. Infekterer dyr, planter, sopp og bakterier. Delt i rekkene Duplornaviricota og Pisuviricota

Eksempler på dobbelttrådet RNA-virus:

Reoviridae (rotavirus, orthoreovirus, cypovirus, blåtungevirus (Orbivirus), fytoreovirus)

Birnaviridae

Cystoviridae (bakteriofag phi(φ)6

Totiviridae

Litteratur

Baltimore D: Expression of animal virus genomes. Bacteriological Reviews. 35 (3) (1971): 235–41, doi:10.1128/MMBR.35.3.235-241.1971

Wikipedia

Tilbake til hovedside

Publisert 11. feb. 2022 14:06 - Sist endret 22. nov. 2023 15:19