RNA genomet fra 5' til 3'-ende:
...5’-UTR-C-M-E-NS1-NS2-NS2B-NS3-NS4A-NS4B-NS5-3’-UTR
koder for kapsidprotein C,glykoprotein E som deltar i reseptorbinding til vertscellen, samtog virusmembranproteinet M. Proteinet E binder seg til glykosaminglykoproteiner på vertscellene. Genomet koder for 7 ikke-strukturproteiner NS. NS5 innholder mehyltransferase og RNA polymerase. NS4B hemmer signalveien for interferon i vertscellene. NS4A er en kofaktor i vurusreplikasjonen. NS3 er en serin protease som kløyver polyproteinet til enkeltproteiner og virker som en helikase. NS2A deltar i sammenkoblingen av vironet og gir celledød. NS2B er en kofaktor for BS3.NS1 er kofaktor i virusreplikasjonen.
Orthoflavivirus nilense er taksonomisk plassert i overrike Riboviria, rike Orthornavirae, rekke Kitrinoviricota, klasse Flasuviricetes, orden Amarillovirales, familie Flaviviridae og slekt Flavivirus.
Litteratur
Wikipedia