Glyoksylsyre er en karboksylsyre og organisk syre som inneholder to karbonatomer. Glyoksylat er den konjugerte basen til lyoksylsyre. Glyoksylat er et intermediat i glyoksylatsyklus i bakterier, gjær og planter hvor fettsyrer blir omdannet til karbohydrater i revers glykolyse (glukoneogenese). Eenzymet isocitrat lyasei glyoksylatsyklus omsetter isocitrat til glyoksylat og succinat. I fotorespirasjon i planter blir glykolat omformet til glyoksylat i peroksisomene katalysert av enzymet glykolat oksidase. Glyoksylat transamineres til aminosyren glycin katalysert av glutamat glyoksylat aminotransferase. Hos mennesker blir glyoksylat laget fra oksidasjon av glykolat (glykolsyre) i peroksisomer eller fra katabolisme av hydroksyprolin i mitokondriene. Glyoksylat kan bli transaminert til aminosyren glycin katalysert av alanin glyoksylat amiinotransferase i peroksisomene (AGT1) eller omsatt til oksalsyre (oksalat) katalysert av glykolat oksidase.
I mitokondriene blir glyoksylat transaminert til glycin analysert av glyoksylat amiinotransferase (AGT2). Eenzymeter reversibelt og katalyserer overføringen av en aminogruppe av L-alanin til glyoksylat, og dermed produserer pyruvat og glycin.
Oksalsyre eller salter av oksalsyre i form av kalsiumoksalat inngår i dannelse av nyrestein. Enzymet oksalyl koenzyme A dekarboksylase deltar i katabolisme av oksalsyre og bruker vitamin B1 som kofaktor
oksalyl-CoA ↔ formyl-CoA + CO2
Enzymet deltar i metabolisme av glyoksylat og dikarbksylat.