DNA- og histon-metylering
Metylering av cytosin i DNA eller metylering av lysin i histoner er med på å regulere uttrykk av gener (epigenetikk). Metylerte gener er ofte inaktive. Sulfonamider hemmer folinsyntesen hos bakterier.
RNA-metylering
RNA-metylering er en post-transkripsjonsregulering. S-adenosylmetionin er metyldonor katalysert av metyltransferase og gir metylering av nukleosider i RNA (mRNA, tRNA, rRNA, ikke-kodende små RNA (sncRNA), langkjedete ikke-kodende RNA (lncRNA). N6-metyladenosin av ribosomalt RNA og mRNA påvirker tredimensjonal pakking og folding av RNA. N6-metyladenosin er en vanlig form for metylering i mRNA, rRNA og lncRNA, Enzymene som deltar i metylering, demetylering og avlesing av metyleringen: Metyleringsspesifikk metyltransferase (skriver), demetylase (viskelær), spesifikk RNA-metylering gjenkjenningsprotein (leser).
Små nukleolare RNA (snoRNA) er små RNA som deltar i styring av modifiseringen av ribosomalt RNA (rRNA), tRNA og snoRNA i nukleolus i cellekjernen. Modifiseringen er blant annet 2’-O-ribose-metylering og pseudouridylering hvor nukleosidet uridin isomeriseres til pseudouridin (psi, Ψ).
S-adenosylmetionin virker blant annet som en metyldonor.
Metyl-metionin kan også virke som metyldonor.