Serin proteaser

Serin proteaser tilhører enzymgruppen proteaser, proteolyttiske enzymer som spalter peptidbindinger i proteiner, og deltar i mange forskjellige biologiske prosesser hos både prokaryoter og eukaryoter.  Alle serin proeaser inneholder en gruppe med tre aminosyrer: histidin, asparaginsyre og serin, en katalytisk triade. Aminosyren serin har en spesiell funksjon i det aktive sete, den substrat-bindende lommen i proteasen som foretar den katalytiske spaltingen av peptidbindingen.  Serin inneholder en hydroksylgruppe som virker som nukleofil i bindingen til det aktive sete. Serin proteaser deltar blant annet i fordøylesessystemet og i komplementsystemet i immunsystemt som beskytter mot sykdom.

Serinproteaser deltar i omdanning inaktive zymogener til aktive enzymer e.g. tryprinogen → trypsin, kymotrypsinogen → kymotrypin, proelastase → elastase

Mange typer peptidhormoner blir laget som prohormoner som deretter blir omsatt av protease i regulerte metabolismeveier.  

Serin proteaser har anitmikrobiell aktivitet som konvertaser

Aktiviteten til serin protaser kan bli hemmet av proteaseinhibitorer (protasehemmere)

Serin proteaser kategoriseres avhengig av substratspesifisiteten som kymotrypsin-,trypsin-, elastase-, trombin- eller subtilisin-lignende.  

Trypslinlignende serin proteaser bryter peptidbindingen etter det positivt ladete aminosyrene lysin og arginin hvor det er positivt ladete aminosyrene asparaginsyre eller glutaminsyre i lommen på det aktive sete på serin proteasen.

Kymotrypsinlignende serin proteaser bryter peptidbindingen ved de aromatiske aminosyrene tyrosin, tryptofan og fenylalanin.

Trombinlignende serin proteaser som deltar i nedbrytning av plasmaproteiner. Noen av dem inngår i slangegift.

Elastaselignende serin proteaser som bryter i tilknytning til aminosyrene alanin, glycin og valin

Subtilisinlignende serin proteaser har likhetstrekk med subtilisin i prokaryoter.  

Databasen MOPS for proteaser med 16 superfamilier som er videre delt i familier. Serinproteaser hører superfamilien S som bruker ainosyren serin som nukleofil

Hydroksylgruppen i serin viker som en nukleofil som angriper karbonyl-karbonet i det kovalente scissilbindingen i peptidbindingen.To elektroner fra nitrogenatomet i histidin mottar hydrogen (H) fra hydroksylgruppen (OH) i serin. Syregruppen på asparaginsyre danner en hydrogenbinding med histidin og som gjør N-atomet i histidin mer elektronegativt.

Litteratur

Wikipedia’

Tilbake til hovedside

Publisert 30. aug. 2024 12:00 - Sist endret 4. sep. 2024 12:16